和MyEclipse不一样，在Eclipse中做的Web项目默认是不支持将项目发布到Web服务器上的，会发布到工作空间的某个目录，因此无法在外部启动Tomcat来运行Web项目，只有打开Eclipse中的服务器，才能运行Web项目。所以要对Eclipse进行修改，才能将做好的项目，发布到Tomcat服务器上，发布到服务器上的Webapps文件夹下。
在Eclipse中，默认会把Web项目放到Eclipse的工作空间下的.metadata\.plugins\org.eclipse.wst.server.core\tmp0(或者是tmp1)\wtpwebapps\下，如果现在Eclipse中有名为access的项目，将它按以前的方式部署到服务器上，则会在上边的目录下，看到自己的项目了，如图所示：
为了能将做好的Java Web项目放入到Tomcat的Webapps下，需要按照如下的步骤进行更改：
1、在该服务器上，单击鼠标右键选择“Open”,或在空白处按F3快捷键，或者是双击，打开如下的页面
2、如果是灰色不可选状态，需要做的是在Eclipse中的最底下的Servers视图，将所有部署的项目Remove All>>，如图所示：再进行操作1
3、在“Server Locations”处选择“Use Tomcat installation”，默认是“Use Workspace metadata”，即最上边的目录。
修改完成之后，保存即可。这样以后的项目都会发布到tomcat下的Webapps下了。
注意：在Eclipse中，用这种方式发布Web项目，会将原先服务器的conf文件夹被分成为backup文件夹，自己新建立一个文件夹，来作为配置Eclipse发布的Web项目。所以还是要使用MyEclipse编写Java Web项目。
那配置这个路径干嘛呢？有什么区别吗？
Use Workspace metadata模式（项目部署在eclipse的工作空间下）
优点：此种模式相当于将tomcat的部分文件拷贝到如上路径下，启动时候不用加载tomcat其他页面速度较快。
缺点：正因为是拷贝部分tomcat到如上路径，所以没法看到tomcat的欢迎页面。
Use Tomcat installation模式（项目直接部署在Tomcat的工作空间下）
优缺点：与上一个模式相反