卡拉托斯结合了波普尔和库恩的理论，提出了“科学研究纲领”，这个“科学研究纲领”的内容比较丰富，提出了一堆新概念，什么内核，保护带之类的。我们都略过不提。简单说，科学研究纲领就是在说，每一个研究都是在一个纲领内部进行的。同时有很多纲领并行。彼此博弈，有的在进步，有的在退化。最终，进步的会发展壮大，退步的则会逐渐衰亡。不过，也不绝对，有时候，退步的会重现生机、返老还童，进步的也可能突然转向消亡。一套思维方式，一旦产生，它可能会衰退，但是很难彻底灭绝。科学是这样，人类的其他认知领域也都是这样。我们过去以为的真理越辩越明，进步必然战胜落后的观念，其实不符合事实。不管你觉得自己的想法有多对，也不管你的想法被事实证明得有多彻底，你想法的反面会一直存在。每一个对世界的看法，都不会消失，每一个对世界的看法也都在抓住一切机会证明自己的正确。它会回来的。你还别小看它们翻盘的机会。
理解拉卡托斯的科学研究纲领论，还有一个好处，就是对他人的错误，有更多的理解和同情能力。就拿我们今天说的这几位哲学家来说，简单理解波普尔的理论，他就是强调批判，忽视了建设的作用，而库恩高他一筹，拉卡托斯通过整合，又高一筹。但是，如果深入到思想的细节，怎么会这么简单？波普尔是20世纪最伟大的思想家之一，是非常有深度的，人中龙凤啊。如果我们今天采访波普尔，会发现我们今天对他的所有批判，他都能给出合理的解释。他对建设的作用当然是有考虑的，建设的作用在他的体系中当然也是有位置的。他是有整套的解释的。但是没有办法，在辩论中能够呈现的只是思想的内核，是被抽掉了很多细节的。所以，即使在论战中，波普尔看起来输了，也不证明他就是错了。用我们今天的来说，是他的那套研究纲领暂时性地衰退了。
在知识的世界中，一切想法都是宝藏，一切失败的都有可能回来，一切自以为正确的，都必须用持续的努力来证明自己。
所以事实证明，有些我们可能自以为是谬误的东西，比如宗教、鬼神，并不会消失，并且它们可能和我们科学的思想观念并行。一个科学家也可以是一个宗教信仰者，相信科学，同样可以相信宗教。由此我也认识到，我们的思维，价值观是可以并行的，而非互斥、互不相容。我们应该以更加理性的态度去包容和我们不一致的观念，这个世界并且只认对错，也没有在每个人看来都永恒的绝对的真理。多去理解不同领域的思维方式和价值观体系，让他们能并行存在你观念中，在未来某一刻的交织让你灵光一现。