LSF常用命令

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leon.sh

#!/usr/bin/csh

#BSUB -o ./log.log -e ./err.err

#BSUB -W 10

#BSUB -n 1

#BSUB -J xief

#BSUB -m Jasta

perl ./test.pl  

exit

提交作业 bsub < leon.sh

LSF 使用 bsub 命令来提交作业。 
bsub 命令常见用法如下: 
bsub –n z –q QUEUENAME –i inputfile –o outputfile COMMAND 
其中z代表了提交作业需要的cpu数,–q指定作业提交到的队列,如果不采用–q选项,系统把作业提交到默认作业队列。
inputfile 代表程序需要读入的文件名(例如 namelist等),outputfile 代表一个文件,作业提交后标准输出的信息将会保存到这个文件中。COMMAND是用户要运行的程序。 
(1)对于串行程序COMMAND可以直接使用用户的程序名 
例如,对一个串行作业mytest, 提交方式为: 
bsub –n 1 –q debug –o mytest.out ./mytest 
(2) 对于并行作业COMMAND为“mpirun.lsf 程序名” 
例如对于一个72个小时内完成,使用16个cpu的并行作业mytest,提交方式为: 
bsub –n 16 –q normal –o mytest.out mpirun.lsf ./mytest 
例如对于一个72小时内完成,使用64个CPU的并行作业mytest,提交方式为:
bsub –n 64 –q hpc_linux –o mytest.out mpirun.lsf ./mytest 
bsub 命令可以使用输入脚本提交具有相同参数的作业,格式为: 
该脚本的参数与命令行 
“ bsub –n Z –q QUEUENAME –o outputfile COMMAND”参数相同。 
提交时为 bsub < 脚本名 
例如要提交一个72小时内完成,需要16个cpu的并行作业mytest,可以编写作业脚本 bsub.scriptfile 
#BSUB –n 16 
#BSUB –q normal 
#BSUB –o mytest.out 
mpirun.lsf ./mytest 


作业提交方法为:bsub<bsub.scriptfile 

bsub -Is ./mytest 这种提交方法可以将mytest的标准输出打印在屏幕

几个常用的指令: 
bjobs 检查提交作业状态 
bjobs 
bjobs -w 
bjobs –r 显示正在运行的作业 
bjobs –a 显示正在运行的和最近完成的作业 
bjobs -p 显示等待运行的作业和等待原因 
bjobs –s 显示正在挂起的作业和挂起的原因 
bjobs -l 显示该作业的所有信息 
bhist 显示最近完成作业或正在运行作业的历史情况 
bhist <jobid> 
bkill 删除不需要的作业 
bkill <jobid> 
bkill –r <jobid> 
bpeek 当作业正在运行时显示它的标准输出,监视作业运行 
bpeek <jobid> 
bqueues 显示队列信息 
bqueues 
bqueues –l <queue name> 
bhosts 显示各节点作业相关情况 
bhosts 
bhosts <hostname> 
lsload 显示各节点负载信息 
lsload 
lsload <hostname> 
lshosts处理各节点静态资源信息 
lshosts 
lshosts <hostaname> 

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