首先安装caffe的时候Python的版本可选系统自带的Python2.7或者Python3.5，也可以使用anaconda中的Python版本，对应的Makefile.config中的Python路径对应的改变。
Caffe安装中多版本protoc选择问题
安装protobuf的方法也有好几种：
sudo apt-get install libprotobuf-dev protobuf-compiler # Linux系统级的安装
sudo pip install google protocol # python2.7版本的安装
sudo pip3 install google protocol # python3.5版本的安装
conda install protobuf # anaconda版本的安装查看系统中已安装的protobuf：
whereis protoc # 查看那些路径下安装了protobuf
which protoc # 查看默认选用的protobuf
protoc --version # 查看当前默认的protobuf的版本
sudo protoc --version # 查看系统的protobuf的版本
所以在编译caffe如果报的错关于Google或者protobuf的，例如：
.build_release/src/caffe/proto/caffe.pb.h:12:2: error: #error This file was generated by a newer version of protoc which is error: #error incompatible with your Protocol Buffer headers. Please update
ImportError: No module named 'google'问题往往存在于系统上存在多个protobuf的版本，而系统默认的版本不能满足编译caffe的要求，这个时候我们可以修改makefile文件的这两行，改为自己希望用的版本目录，例如改为使用系统的：
$(Q)protoc --proto_path=$(PROTO_SRC_DIR) --cpp_out=$(PROTO_BUILD_DIR) $<
$(Q)protoc --proto_path=$(PROTO_SRC_DIR) --python_out=$(PY_PROTO_BUILD_DIR) $<
改为
$(Q)/usr/bin/protoc --proto_path=$(PROTO_SRC_DIR) --cpp_out=$(PROTO_BUILD_DIR) $<
$(Q)/usr/bin/protoc --proto_path=$(PROTO_SRC_DIR) --python_out=$(PY_PROTO_BUILD_DIR) $<
参考：