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C#是一种编译语言，不是脚本语言。 脚本语言不会被编译，而只是逐条语句读取并进行解释(读取一条语句，翻译成机器码或者虚拟机码并立即执行，一条指令有可能翻译成多条机器指令)，这对于像javascript这样的东西很有用，但是当对性能有要求时，编译语言就是可行的方法。
.NET 框架包含编译器，运行时和库。
一般而言，.NET是一个编程环境，除了其他东西外，还包含一个虚拟机CLR(Common Language Runtime)和一个广泛的类库BCL(Base Class Library)。
C#是一个针对.NET环境的编程语言，C#被编译成IL(一种用CLR执行的汇编语言)， 并使用BCL中的类。
C# 是一种与C++ 非常相似的编程语言，而.NET是一个库、类和现成的方法的集合。.NET和 C# 紧密相关，每一个using语句都从.NET导入一个类的集合到用户的项目中。
总结:
NET 是一个编码框架。
C# 是一种设计用来利用.NET优势的语言。
另: Visual Basic 也是一种 .NET 语言，选择C#还是VB只是一种偏好问题。而 Visual Studio 是一个协助用户进行.NET编码的工具。
这就是二者之间的关系。