无论Windows还是Linux，安装软件实质是复制一些列文件到磁盘中。这些文件包括动态和静态库（包含二进制内容的文件）、头文件、可执行文件，以及一些配置文件等。
除了复制文件，为了让其他程序能够找到这些文件，都需要设置全局变量（比如path)来供其他程序检索定位这些文件的位置。Linux中，添加了默认的库、程序、头文件的搜索路径，我们也可以自定义这些搜索路径。
安装程序的实质是复制文件到磁盘上，因此，到底将文件复制到哪里，变得十分关键。默认情况，程序的文件会按照其类型，复制到/usr/local/目录下。比如，库文件会复制到/usr/local/lib；头文件会复制到/usr/local/include；一些共享信息，如程序文档，会复制到/usr/local/share。在每个类别文件夹中，程序会集中存放。有时为了防止命名冲突，某个程序的文件会单独放在一个文件夹中。比如程序abc的lib文件，会放到/usr/local/lib/abc/目录下。
通常来说不会出现文件名称冲突的情况
在使用configure的时候，可能我们权限不足，无法向/usr/local文件夹中写入数据；或者为了文件布局清晰，希望放入/home/username目录下。此时，我们可以使用参数：–prefix=/home/username/usr/local。该参数等号右边的值为安装程序的目标目录，程序所有的文件都将放入该文件夹。
当我们安装n个程序到同一个目录下时，相同的文件夹不会被覆盖。同一类型的文件会被集中存放。比如下面的例子：
我计划安装程序a, b, c三个程序。他们安装后的具体分布如下：
a: lib, include, lib64, libexec, share
b: lib, include, bin, share
c: lib, include, bin, sbin
此时，三个程序分别将对应文件安放在/home/username/usr/local目录下的几个目录中：
lib, include, lib64, libexec, share, bin, sbin
程序开发者能够保证这些程序的文件不会出现重名。因此，我们安装程序，只会不停的append，而不会出现overwrite的情况。如果希望进行更精细的配置，比如，希望程序a的头文件放到/home/username/headers中，可以使用 –includedir=/home/username/headers参数来指定。具体可以参见文章：
在调用程序的时候，由于安装目录是我们自己定义的，因此系统无法知道我们到底把程序放在哪里。此时有两种方式：
1，将可执行文件的路径添加到全局变量中，这样Linux就能通过全局变量，搜索到程序。
2，使用全局路径，或者转到程序所在的目录执行程序。