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本文章只介绍如何在Linux下安装最新版QIIME2软件，具体的软件使用及其他内容见QIIME2官方文档，请参考：https://docs.qiime2.org/2018.6/ #点击链接会自动在网址前加入http://，请手动去掉或者复制链接打开
安装步骤如下：
1.下载安装anaconde2
Linux下下载的是文件是Anaconda2-5.0.1-Linux-x86_64.sh，下载完成后直接运行bash Anaconda2-5.0.1-Linux-x86_64.sh，一步一步按照指示往下走，最后问询问安装位置，默认位置为用户主目录，也可以自己选择安装位置；还会询问是否将anaconde加入到.bashrc默认路径中，如果加入路径就会在使用python时默认使用anaconde，我的选择是加入，加入后要么重启终端，要么source .bashrc，这样才能生效。
2.更新conda
conda update conda #将conda升级为最新版的，新版conda的bug最少，碰到问题的机会也小
3.安装（升级）wget
conda install wget
4.下载QIIME2-2018.6编译文件
wget https://data.qiime2.org/distro/core/qiime2-2018.6-py35-linux-conda.yml
5.编译QIIME2
conda env create -n qiime2-2018.6 --file qiime2-2018.6-py35-linux-conda.yml
编译安装QIIME2，这一步会下载安装所有的依赖文件，所以会下载很多东西，耗时较久，具体速度看网速。
6.激活工作环境
source activate qiime2-2018.6
7.检查是否安装成功
qiime --help
如图，若能弹出帮助程序即安装成功。
8.关闭工作环境
source deactivate
当不使用时要关闭QIIME2工作环境，否则会对其他程序产生影响，造成其他程序出错。