发现 R 3.0.2 不支持 ggplot2 , ubuntu 默认的有时 3.0.2 , 只能下载 src 编译

参考网址：http://blog.itpub.net/21711990/viewspace-1114418/

http://blog.sina.com.cn/s/blog_8353c4e90102vp1j.html

1、下载
wget http://mirror.bjtu.edu.cn/cran/src/base/R-3/R-3.0.1.tar.gz

https://cran.r-project.org/src/base/R-3/ 其他版本

2、解压：
tar -zxvf R-3.0.1.tar.gz
cd R-3.0.1

3、安装 (当然也可以跳过)
yum install readline-devel
yum install libXt-devel
./configure

4、配置环境并编译安装
# 如果使用rJava需要加上 --enable-R-shlib (这个我不需要，所以加入到后面)
# 如果3没安装, 那么后面加上： --with-readline=no --with-x=no
./configure --prefix=/media/l/app/spark/R/install --enable-R-shlib=yes --with-libpng-x=no --with-tcltk

要支持 rstition 要加上 --enable-R-shlib=yes --with-libpng-x=no --with-tcltk

make $$ make install

5、配置环境变量并生效
vi .bash_profile
export R_HOME=/usr/R-3.0.1
export PATH=.:$R_HOME/bin:$PATH

# 试环境变量生效
source .bash_profile

6、命令行测试
[admin@JD software]$ R
WARNING: ignoring environment value of R_HOME

R version 3.0.1 (2013-05-16) -- "Good Sport"
Copyright (C) 2013 The R Foundation for Statistical Computing
Platform: x86_64-unknown-linux-gnu (64-bit)

R是自由软件，不带任何担保。
在某些条件下你可以将其自由散布。
用'license()'或'licence()'来看散布的详细条件。

R是个合作计划，有许多人为之做出了贡献.
用'contributors()'来看合作者的详细情况
用'citation()'会告诉你如何在出版物中正确地引用R或R程序包。

用'demo()'来看一些示范程序，用'help()'来阅读在线帮助文件，或
用'help.start()'通过HTML浏览器来看帮助文件。
用'q()'退出R.

> q()

7、创建脚本测试(t.R)
cd /opt/script/R
vim t.R

#!/path/to/Rscript #第一行
x<-c(1,2,3) #R语言代码
y<-c(102,299,301)
model<-lm(y~x)
summary(model)

8、测试：执行脚本
R CMD BATCH --args /opt/script/R/t.R
more /opt/script/R/t.Rout #查看执行的结果
或者第二种方式
Rscript /opt/script/R/test.R #结果直接输出到终端

网上提示：
recompile with -fPIC

重新运行：

[root@IPZHWG-AAA-01 resin]# CFLAGS="-fPIC"

make clean 后

./configure --prefix=/media/l/app/spark/R/install --with-readline=no --with-x=no --enable-R-shlib=yes --enable-shared

# make
# make install

~/.bashrc

export R_HOME=/media/l/app/spark/R/install

export PATH=.:$R_HOME/bin:$PATH

用 qqplot2 绘画有问题报错

Semi-transparency in RStudio

had exactly the same problem as the OP, but in my case setting options(bitmapType="cairo")did not solve the problem.

In my case the problem was caused by the fact that I compiled R manually from source without the --with-cairo configure option (or rather: my system was lacking the necessary libcairo2-dev package, the --with-cairo did not have any effect). Recompiling R with proper cairo support fixed the issue. It now even works although getOption("bitmapType") is still set to `"Xlib".

install R

Semi-transparency in RStudio

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