利用openbabel2.4.1进行小分子构象搜索

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利用open babel产生小分子多重构象的方法有两种：

一，使用遗传算法（遗传算法）进行构象搜索，属于系统式搜索最低能量构象的方法

obabel -L conformer 命令可以详细查看conformer插件的使用方法

以下命令可以为小分子生成20个小分子构象，然后使用-writeconformers参数将所有的构象写成输出结构文件：

obabel ligand.mol2 -O lig_conformers.sdf --conformer --nconf 20 --score rmsd --writeconformers

二，使用Confab进行构象搜索，属于随机性搜索方法

obabel -L confab命令可以查看confab的详细用法

obabel <inputfile> -O <outputfile> --confab [confab options]

参考链接：

https://open-babel.readthedocs.io/en/latest/3DStructureGen/multipleconformers.html