RStudion | 基础使用教程（初学者详细） | 基本设置 | 快捷操作 | 脚本运行 | 画图

编程语言 2023-12-17 09:30:18 阅读次数: 0

RStudion | 基础使用教程 | 基本设置 | 快捷操作 | 脚本运行 | 画图

一、RStudio界面布局

在之前的文章中介绍过R及RStudio的安装、更新等基础内容，内容如下：

本篇则主要介绍R语言的常用编辑器RStudio，在安装RStudio并打开后，界面如图1所示。
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图1 RStudio默认分布排版

但通常情况，我们利用RStudio来编写和记录脚本，故可按照“File——New File——R Script”（图2）的顺序添加R脚本窗口，添加后的窗口布局如图3。
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图2 RStudio创建R脚本文件

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图3 RStudio常规分布排版

二、RStudio基础设置

关于RStudio的基础参数设置，可以在“Tools——Global Options”（图4）中找到。
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图4 RStudio基础设置

2.1 general | 常规设置

RStudio常规设置中主要包括（图5）:

  • R版本更改；
  • 工作路径设置；
  • 新打开RStudio内容（程序+源文件）设置;
  • .RData数据保存设置；
  • 选项卡之间的快捷切换；
  • RStudio更新及内容报告。

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图5 RStudio常规设置

注:
在打开RStudio之前，利用“ctrl + 点击RStudio图标”快捷键也可以进行R版本的选择。

2.2 Code | 代码

RStudio代码设置中主要包括（图6）:

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  • 代码缩进量、自动补齐等代码风格设置；
  • 代码及符号等的高亮显示设置；
  • 文件保存及编码设置；
  • 代码补齐参数设置；
  • 代码诊断参数显示设置。

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图6 RStudio代码设置

注:
“Ctrl + 单击链接”，可在默认浏览器中打开编辑器中的链接。

参考:
RStudio设置选项(全)——2. Code

2.3 Console | 控制台

RStudio控制台设置中主要包括（图7）:

  • 代码显示及输出元素设置；
  • 报错内容设置。

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图7 RStudio控制台设置

注:
“options(max.print=num) ”可以修改元素的显示数量。

2.4 Appearance | 外观

RStudio外观设置中主要包括（图8）:

  • 主题设置；
  • 代码字体设置。

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图8 RStudio外观设置

注:
“R包rsthemes ”可以对RStudio主题进行修改设置。

2.5 Pane Layout | 排版布局

RStudio排版布局设置中主要包括（图9），对应于图3:

  • 脚本文件窗口内容；
  • 控制台窗口设置；
  • 环境变量、历史等窗口；
  • 文件、绘图输出等窗口。

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图9 RStudio排版布局设置

脚本文件（source）窗口（图10），主要用于打开不同类型的脚本文件（.R、.rmd、.py等）。可同时打开多个活动文件，并对代码命令进行编辑。
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图10 RStudio source窗口

控制台（console）窗口（图11），主要用于执行代码命令、提供后台运行R脚本功能。
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图11 RStudio source窗口

环境变量（environment）窗口（图12-13），包括Environment、History、Connections、Build、Version Control System (VCS)及Tutorial选项卡。

此处仅列出Environment（查看变量及对象）、History（显示已执行命令行，可对其进行加载、保存和删除）及Tutorial（教程） 选项卡包含内容。
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图12 RStudio 环境变量及历史记录窗口

教程选项卡（图13），首次安装R后，此处会提醒需要安装R包 “shiny”及“learner”，按照提示点击链接安装即可。

安装完成后即可打开对应内容进行查看，R包安装及示例如下（图13）。
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图13 RTutorial窗口

文件输出（File）窗口（图14），包括Files, Plots, Packages, Help, Viewer和Presentation选项卡。

此处仅列出Files（工作路径及当前路径下的文件内容）、Plots（绘图显示）及Packages（R包安装及更新） 选项卡包含内容。
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图14 RStudio 文件、绘图、R包及帮助文档窗口

2.6 Packages | R包

RStudio Packages设置中主要包括（图15）:

  • R包管理；
  • R包创建。

R包下载安装的镜像源也可以通过以下代码直接进行查看和修改：

# R包当前镜像源查看
> getOption("repos")
                                        CRAN 
"https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/" 
attr(,"RStudio")
[1] TRUE

# R包  CRAN镜像源修改
options(repos=structure(c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/")))

# R包  bioconductor（生物信息相关R包）镜像源修改
options(BioC_mirror="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/bioconductor")

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图15 RStudio Packages设置

官方介绍：

其他相关内容：

2.7 R Markdown

R Markdown 是一种用 R 制作动态文档的文件格式（.Rmd）。R Markdown 文档是用 markdown（一种易于书写的纯文本格式）编写的，其中包含嵌入式 R 源代码块、输出结果及图形展示等。方便同行之间进行交流，可以转换为HTML、PDF及Word等多种格式的报告文件。

RStudio R Markdown设置中主要包括（图16）:

  • .Rmd格式文件基础参数设置；
  • .Rmd格式文件可视化等参数设置。

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图16 RStudio R Markdown设置

相关介绍：

2.8 Python

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图17 RStudio Python设置

2.9 Sweave | R编译函数

RStudio Sweave设置中主要包括（图18）:

  • PDF生成参数设置；
  • R包创建。

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图18 RStudio Sweave设置

官方介绍：

2.10 Spelling | 拼写检查

RStudio Spelling设置中主要包括（图19）:

  • RStudio词典选择设置；
  • 拼写检查参数设置。

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图19 RStudio Spelling设置

2.11 Git/SVN

RStudio Git/SVN设置中主要包括（图20）:

  • Git/SVN可执行文件位置的设置；
  • SSH密钥与GitHub的链接。

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图20 RStudio Spelling设置

2.12 Publishing

RStudio Publishing设置中主要包括（图21）:

  • 发布账户及相关证书内容设置。

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图21 RStudio Publishing设置

相关介绍：

2.13 Terminal | Accessibility

相关介绍：

三、RStudio快捷操作

快捷操作 描述
? 查询帮助文档
tab键 显示所有的代码补全选项
alt + shift + k 打开快捷方式面板
ctrl + 左键点击链接 默认浏览器打开该链接；跳转该链接路径下的文件内容
ctrl + enter 运行选中代码命令行
ctrl + tab 在打开的选项卡之间切换
ctrl + alt + c 复制文件地址
ctrl + alt + p 重新运行上次的命令
ctrl + shift + enter 运行所有代码行命令
ctrl + Shift + C 批量注释/取消注释
ctrl + Shift + H 打开一个弹出窗口并选择工作目录
ctrl + Shift + M 管道工具（％>％）
ctrl + Shift + P 显示命令面板
ctrl + 点击RStudio图标 R版本的选择
rm() 删除环境变量中特定数据集、函数等内容
rm(list()) 删除环境变量中特定数据集、函数等内容
gc 清除内存
ctrl+L 清除控制台中输出内容
load 加载已保存的工作空间.RData
options(max.print=num) 可以修改输出元素的显示数量
---- 添加标题显示
# 通过不同“#”表示标题级别

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图22 标题显示设置

四、RStudio脚本运行

4.1 R包加载

  1. 通过函数 “library()” 或 “require()” 加载R包
> library(dplyr)

载入程辑包：‘dplyr’

The following objects are masked from ‘package:stats’:

    filter, lag

The following objects are masked from ‘package:base’:

    intersect, setdiff, setequal, union

> require(R包名称)
  1. 通过RStudio文件窗口中的 “packages” 窗格勾选对应R包

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图23 R包加载

4.2 R包查询和使用

  • 通过 “.libPaths()”函数查询R包的安装路径，如下所示：
> .libPaths()
[1] "C:/Users/hp/AppData/Local/R/win-library/4.3"
[2] "D:/Program Files/R/R-4.3.1/library"
  • 通过 “available.packages()”函数查询所用电脑可以安装的R包，如下所示：
> available.packages()
                                 Package                            Version         
A3                               "A3"                               "1.0.0"         
AalenJohansen                    "AalenJohansen"                    "1.0"           
AATtools                         "AATtools"                         "0.0.2"
  • 通过 “library()” 或 “installed.packages()” 函数查询所有路径下安装的R包，如下所示：
> library()

> installed.packages()
              Package         LibPath                                       Version   
askpass       "askpass"       "C:/Users/hp/AppData/Local/R/win-library/4.3" "1.2.0"   
backports     "backports"     "C:/Users/hp/AppData/Local/R/win-library/4.3" "1.4.1"   
base64enc     "base64enc"     "C:/Users/hp/AppData/Local/R/win-library/4.3" "0.1-3"
  • 通过 “search()” 或 “(.packages())” 函数查询目前已加载的R包，如下所示：
> search()
 [1] ".GlobalEnv"        "package:dplyr"     "tools:rstudio"     "package:stats"    
 [5] "package:graphics"  "package:grDevices" "package:utils"     "package:datasets" 
 [9] "package:methods"   "Autoloads"         "package:base"

> (.packages())
[1] "dplyr"     "stats"     "graphics"  "grDevices" "utils"     "datasets"  "methods"  
[8] "base"
  • 通过 “sessionInfo()” 函数查询已安装R包版本，如下所示：
> sessionInfo()
R version 4.3.1 (2023-06-16 ucrt)
Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit)
Running under: Windows 11 x64 (build 22621)

Matrix products: default


locale:
[1] LC_COLLATE=Chinese (Simplified)_China.utf8  LC_CTYPE=Chinese (Simplified)_China.utf8   
[3] LC_MONETARY=Chinese (Simplified)_China.utf8 LC_NUMERIC=C                               
[5] LC_TIME=Chinese (Simplified)_China.utf8    

time zone: Etc/GMT-8
tzcode source: internal

attached base packages:
[1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base     

other attached packages:
[1] dplyr_1.1.3

loaded via a namespace (and not attached):
 [1] digest_0.6.33     utf8_1.2.3        R6_2.5.1          fastmap_1.1.1    
 [5] tidyselect_1.2.0  xfun_0.40         magrittr_2.0.3    glue_1.6.2       
 [9] tibble_3.2.1      knitr_1.44        pkgconfig_2.0.3   htmltools_0.5.6  
[13] generics_0.1.3    rmarkdown_2.25    lifecycle_1.0.3   cli_3.6.1        
[17] fansi_1.0.4       vctrs_0.6.3       rsconnect_1.1.1   compiler_4.3.1   
[21] rstudioapi_0.15.0 tools_4.3.1       pillar_1.9.0      evaluate_0.21    
[25] yaml_2.3.7        rlang_1.1.1
  • 通过 “help()”函数对R包的函数功能进行查询，如下所示：
help(package="R包名称")
  • 通过 “help()”函数对特定函数属于哪个R包进行查询，如下所示：
help("函数名")
  • 通过 “detach(“package:R包名称”)”卸除（取消加载）已加载的R包，如下所示：
detach("package:R包名称")
  • 通过 “remove.packages()”函数卸载R包，如下所示：
remove. packages(c(“R包名称1”,”R包名称2”) , lib = file .path(“输入R包安装路径”, “to”, “library”))
  • 通过 “update.packages()”函数更新R包，如下所示：
update.packages()

4.3 脚本编写、记录及运行

- 脚本编写及记录

通常情况下，可以在《脚本文件窗口》及《控制台》直接输入代码命令，但当运行部分代码命令后，可以在《环境变量窗口、历史》中将运行过的特定代码命令输入到《脚本文件窗口》或《控制台》窗口中，并进行再次运行及保存。
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图24 代码行运行操作

- 脚本运行

  1. 选择需要运行的单行或多行代码，通过 Ctrl + Enter 键或点击 Source 窗口标题栏的 “Run” 按钮。

在这里插入图片描述
图25 代码行运行命令

  1. 运行某一段代码后，通过 ctrl + alt + p 键，可重新运行上一次运行的单行或多行代码命令。
  2. 执行所有命令行，通过 Ctrl + Shift + Enter 键 或使用标题栏上的 Source 按钮。

在这里插入图片描述
图26 所有代码行运行命令

五、RStudio图形绘制

在R安装路径无中文的情况下，运行代码绘图，会在右下角文件窗口的plot窗口中显示绘制图形，如图27。
在这里插入图片描述
图27 plot绘图窗口展示

但当路径下有中文时，RStudio则不显示绘制图形，可通过 “dev.new()” 来创建一个新的图形窗口进行展示，并用 “dev.off()” 关闭创建的图形窗口。

参考内容：

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转载自blog.csdn.net/qq_43210428/article/details/133322910
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