今天，安装了一下用于生信软件freebayes，它用来calling SNP、haplotype的，具体的用法我们后面再探讨，今天主要谈谈在安装freebayes所遇到的问题，其实，这些问题在安装其他软件时，也会遇到。一叶便知秋！下面就具体谈谈是什么问题。
首先你得安装git模块，进行直接网上下载git文档。然后使用下面语句下载freebayes：
git clone --recursive git://github.com/ekg/freebayes.git安装好后会出现一个freebayes文件夹，然后进入它：
cd freebayes之后开始编译，使用make：
make此时，就可能会出现问题，无法编译（因为我的centos安装了g++、gcc、c++，所以这里没有办法演示错误信息）。这个原因就是用g++、gcc、c++编译的软件，必须得要安装g++、gcc、c++，所以这里要使用yum来安装，如果是Ubuntu则用apt-get安装。
sudo yum install gcc-c++然后，接着重新make编译，此时，也许会出现第二个问题：
fatal error: bzlib.h: No such file or directory
其实，这也是一个很常见的问题，那是因为freebayes有python接口，从文件夹里面的python文件夹就可以看出来。
所以，此时还需要安装一个包：
看提示的结果，如果是 patchlevel.h：没有那个文件或目录 ，则：
（这里还有一个地方需要注意：centos和ubuntu安装的包名不一样）
Ubuntu安装法：
sudo apt-get install python-devCentOS安装法：
yum install python-devel看提示的结果，如果是 bzlib.h：没有那个文件或目录 ， 则：
Ubuntu安装法：
sudo apt-get install libbz2-devCentOs安装法：
yum install zlib-devel bzip2-devel sqlite sqlite-devel openssl-devel把这些安装完后，再使用make编译，应该是没有问题。（我是没有再遇上问题了。）
最后安装好了的freebayes：
至此freebayes安装完毕，希望给遇上相同问题的小伙伴可以提供一点帮助！
注：
freebayes帮助文档：
https://github.com/ekg/freebayes/blob/master/README.md
最后也附上，我将此软件打包好后，下载可以直接使用。
http://download.csdn.net/download/llh_1178/10190136