安装miniconda
下载最新版miniconda
wget https://repo.continuum.io/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
安装
bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
注意点:这一步骤里我们输入完命令后会有个License要读,一行一行读的话按Enter,不想读就直接输入q。之后我们就输入两个yes就行
更新一下
source ~/.bashrc
到此miniconda就算安装完了。可以通过下面这个命令验证一下
conda -V
创建一个叫R4.2.2的环境,并安装R。
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conda create -n R4.2.2
conda activate R4.2.2
conda install -c conda-forge r-base=4.2.2
如何用R-后面我们就首先激活环境
conda activate R4.2.2
然后输入一个R就行。退出就输入q()就可以啦~
#进入环境
source activate R4.2.2
conda activate R4.2.2
原过程链接:linux创建小环境并安装R-成功
上面是基本的配置情况,下面说一下安装包的问题
常用的安装包的方式有:
install.packages("units")#直接输入R,进入R环境,安装需要你选择一下镜像
install.packages("units",repos = "https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/")#镜像安装R包,这个是我比较常用的方式,直接加上镜像
library(devtools);devtools::install_github("talgalili/d3heatmap")#通过包来安装包,注意安装包的具体位置
conda install -c conda-forge r-units:上面三种方式都无法安装相关的包,应该就是虚拟环境配置的问题,可直接用conda进行安装
R的库官网有需要的可以直接把包下载下来进行配置安装,记住版本的对应即可