详细步骤：
1、首先要先把my.cnf配置文件复制一份，开几个端口要复制几份当然要重新命名.
如：
cp /etc/my.cnf /etc/my3306.cnf
cp /etc/my.cnf /etc/my3307.cnf
cp /etc/my.cnf /etc/my3308.cnf
2、修改my_1.cnf，my_2.cnf，my_3.cnf文件把默认的3306端口改成 3307 3308 3309.
如：
[client]
port = 3308
socket = /tmp/mysql3308.sock
default-character-set=UTF
[mysqld]
port = 3308
socket = /tmp/mysql3308.sock
basedir=/usr/local/mysql
datadir=/www/mysqldata8
3、创建数据库指定存放数据的目录
mkdir /www/mysqldata3306
mkdir /www/mysqldata3307
mkdir /www/mysqldata3308
4、初始化数据库
/usr/local/mysql/scripts/mysql_install_db --datadir=/www/mysqldata3306/ --user=mysql --basedir=/usr/local/mysql
/usr/local/mysql/scripts/mysql_install_db --datadir=/www/mysqldata3307/ --user=mysql --basedir=/usr/local/mysql
/usr/local/mysql/scripts/mysql_install_db --datadir=/www/mysqldata3308/ --user=mysql --basedir=/usr/local/mysql
5、启动mysql，要指定.cnf文件和目录启动
/usr/local/mysql/bin/mysqld_safe --defaults-extra-file=/etc/my3306.cnf --datadir=/www/mysqldata3306 --user=mysql &
/usr/local/mysql/bin/mysqld_safe --defaults-extra-file=/etc/my3307.cnf --datadir=/www/mysqldata3307 --user=mysql &
/usr/local/mysql/bin/mysqld_safe --defaults-extra-file=/etc/my3308.cnf --datadir=/www/mysqldata3308 --user=mysql &
6、停止MYSQL，对应的sock文件。
/usr/local/mysql/bin/mysqladmin -uroot -S /tmp/mysql3308.sock shutdown
7、登陆mysql
mysql -S /tmp/mysq3308.sock -P 3308
8，可以查询当前开启的所有mysql 服务
chkconfig --list | grep on
附录：
（1）查询linux相关安装信息 ps -ef|grep mysql