机械硬盘的保护，其实很简单。但要想真正的保护硬盘，首先得先从硬盘的原理说起。硬盘的原理其实就是内部的磁头在一片或数片圆形的磁盘上通过电磁流将信息读取或写入。磁盘在硬盘通电后快速旋转，磁头在磁盘上滑动传入主板以达到访问数据。其中硬盘最为精贵就是磁头与磁盘。
造成硬盘损坏的原因有以下几种：
1. 突然断电
硬盘在工作时，磁盘一般都处于高速旋转状态。如果这时突然断电，磁头有可能会划伤碟片，损坏其中数据的完整性。目前一些硬盘里安装了一块极小的「电池」，在外部电源断电的瞬间，机械硬盘会利用这块电池的电量优先将磁头挪动到安全区域，避免划伤碟片。虽然有这样的保护，但在使用过程中，还是应当避免突然断电。
在专业领域，如：监控、服务器等，这些数据要比个人硬盘中的数据更为宝贵。在这些存放数据的硬盘或硬盘组旁，一般都配有 UPS（即不间断电源），在遇到不可抗力的突然断电时，UPS 中配备的蓄电池会代替主电源继续工作，直到电力恢复或蓄电池没电。
2. 大量灰尘
如今的硬盘大部分都是密封机身，一般只有一个过滤的气孔，用来平衡工作时产生的热量导致的气压差。但在灰尘严重的环境下，气孔很容易吸入空气中的灰尘，灰尘长期积累在硬盘的内部，会影响电子元器件的散热，使得电路板等元器件的温度上升，产生漏电而烧坏元件，造成一些莫名其妙的问题。所以灰尘体积虽小，但对硬盘的危害是不可低估的。
因此必须保持环境卫生，减少空气中的湿度和含尘量。这里要注意的是：一般用户不能自行拆开硬盘盖，否则空气中的灰尘进入硬盘内，尝试物理修复请到专业机构，避免在磁头进行读、写操作时划伤盘片或磁头。
3. 外力磕碰
硬盘是一种精密的设备，在工作中磁头与磁盘的互动距离会达到几微米。在受到外力冲击时，磁头会在磁盘上留下损伤。在高温度、高磁场、静电的情况，对硬盘也是损伤很大，从部分数据损坏到整个硬盘报废，都有可能。所以在携带、移动、使用的过程中，一定要多加小心。
可以说，机械硬盘的抗震抗摔能力比较差，不单单移动硬盘，对于机械硬盘都是这样。这个可以从硬盘结构上看。硬盘的抗震性能差就来源于盘片和磁头的接触。它们之间如果有因为震动等造成较强烈的作用的话，就有可能出现物理坏道。
HASS（硬盘主动稳定系统）是万拓存储基于旋转式磁性硬盘（hard disk drive, HDD）的应用研究，不断提高硬盘可靠性的磁盘处理技术，使硬盘故障率减少80%以上。通过数据排队、分类、缓存等技术，大大减少硬盘的机械磨损，延长硬盘的使用寿命。
另外，为了降低硬盘间共振对硬盘造成的损坏，万拓存储研发了获得专利的一体成型导轨，有效改善硬盘间共震，稳定、低噪音。还有获得专利的一体防震托盘架，保证最大进风量，散热更有效，减小磁盘震动。全方位保护硬盘，延长硬盘使用寿命。