按照惯例，遇到Linux相关的问题先说系统版本，我用的是Ubuntu 16.04。
事情的起因是这样的，把打了个jar包扔上服务器，然后nohup java -jar运行，本来一切正常（之前一直都很正常），但这次报了个没见过的错：
The driver has not received any packets from the server。
网上查了一下说是连接超时，然后我就想着打开MySQL去改一下设置，结果发现MySQL连不上了，运行mysql -u root -p报错：
ERROR 2002 (HY000): Can't connect to local MySQL server through socket '/tmp/mysql.sock' (111)。
然后我就按照网上的说法，删掉了/tmp/mysql.sock和/tmp/mysql.sock.lock，然后systemctl restart mysql重启MySQL，结果这次连MySQL服务都没法启动了，报错：
The server quit without updating PID file.
看起来是删文件删出问题了。网上资料基本上是基于5.x的，而MySQL到了8.0之后发生了很大变化，没有找到一个能用的方案。
有人说删掉data目录下ib开头的文件可以解决，我试了一下，除了会导致启动报错之外并没有什么效果。后来查了一下资料才知道，ib开头的文件和InnoDB引擎有关系。
中间还出现了几次not found的错误，后来发现只是因为没有权限而已，chmod一下就好了；但是仍然无法启动，还是那个PID file的报错。
后来看到有人说删掉data重新初始化可以解决，我就试了一下，从某种程度上来说确实算是解决了，因为按照这个流程操作之后，MySQL是可以运行了，但是MySQL的服务仍然是挂掉的，会报错：
ERROR 2002 (HY000): Can't connect to local MySQL server through socket '/tmp/mysql.sock' (2)。
只能说治标不治本，而且root用户的密码还是空的：
rm -rf data
bin/mysqld --initialize-insecure
bin/mysqld -u root &
实在没办法，先是想着能不能把MySQL的系统服务删掉或者改一下，改成启动改过的命令，后来发现不是很好弄，就想着干脆卸载重装算了。
在准备卸载的过程中，看到官网上的安装流程，想着覆盖一下mysql.server是不是能弄好：cp support-files/mysql.server /etc/init.d/mysql.server，后来发现也没啥用……
在rm -rf mysql之前，我想着再最后挣扎一下，因为整个流程中还有一个地方没有检查过，就是mysql用户的权限。打开/etc/passwd之后，把mysql用户的权限改成0，也就是给它root权限，保存之后重新启动服务，它好了……
问题算是解决了，但为什么呢？如果有人知道，请不吝赐教。
