Java SE=Java Standard Edition
Java EE=Java Enterprise Edition
Java ME=Java Mobile Edition
java就是普通的用java写的程序，直接就能运行的
JavaEnterprise 主要是针对Java EE 项目的开发设计的“帮助我们开发和部署可移植、健壮、可伸缩且安全的服务器端Java应用程序”，所以web项目大多都在这个视图中进行开发。功能较前者多一些。
webproject,web service project不能直接运行，必须在容器里面运行，这个容器就是webserver，例如tomcat,jboss。webproject就是web工程，简单的讲做网站的工程，webservice project是以http为通信协议xml为媒介来传输数据以达到运行调用java程序的目的。
1、当你是web应用时，比如说要建个网站，需要发布到服务器时，应该要建Web Project 。
2、当你是做分布式系统时，也就是你做的只是一个服务，对外发布也只是一个服务的时候，需要建立Web Services Project(不理解可以先研究下webservices)。
3、当你仅仅是需要JDK来运行一些本地代码的时候，只需要建Java Project就可以了。
4、Web Project就是普通的jsp项目，基于J2EE标准，符合mvc规范，你可以理解为BS模式的程序。
5、Web Service Project 也是BS程序，只是要用到网络中其他的数据，为了数据之间能更好的通讯必须符合http和xml标准，因此就独立出来叫做WebService Project。
6、 Java Project 就是一般的java项目，不属于BS项目。BS项目最大的特点是客户端的界面都是有浏览器作为载体，但是java project不是，它就是一般的JAVA项目。