重新描写该段文字：在本文中，我们提出了功能目录 (FunCat)，这是一个分层结构的、独立于生物体的、灵活的和可扩展的受控分类系统，可以对任何生物体的蛋白质进行功能描述。FunCat已被应用于原核生物...

在本文中，我们提出了一种名为功能目录(FunCat)的分层结构的受控分类系统，该系统独立于生物体，灵活且可扩展，可以用于描述任何生物体的蛋白质功能。FunCat被用于对原核生物、真菌、植物和动物进行人工注释。