技術プラットフォームを配列決定し、いくつかの一般的な種類があります

技術プラットフォームを配列決定し、いくつかの一般的な種類がありますか

シーケンシング シーケンシングプラットフォーム シーケンシング原理
世代シーケンシング ABI3730、ABI3500 ジデオキシターミネーション法、キャピラリー電気泳動
世代シーケンシング GS 454、固体、イルミナHiSeq 合成方法副接続シーケンシングを配列、パイロシーケンシング
シーケンシングの三世代 PacBio RS、オックスフォードで-oporeミンLON 単一分子配列決定、ナノ細孔シーケンシング

シーケンシング技術は、開発の3つの世代を受け、これまで持っています。

実際には、初期のDNA二重らせん構造の後、すぐに、分解法と呼ばれる(劣化による配列決定、SBD)DNAシーケンシング技術が考案されていましたが、この方法が動作するように複雑であり、不安定な結果、一度に開いて宣伝しないことが分かっとして大規模なアプリケーションを実施しました。次いで、サンガー及びクールソン、1975は「プラスとマイナス」は、DNA配列を決定した(Sangerandクールソン、1975)発明、マクサムおよびギルバートを、1977化学分解配列決定を発明しました。最終的には同じ年に、サンガーは核酸重合反応中のddNTP(ジデオキシヌクレオシド三リン酸)を組み入れ、周知のジデオキシチェーンターミネーション法出生(サンガー、ニックレン、及びクールソン、 1977)。また、同時期に(パイロシーケンシング)をパイロシーケンシングリガーゼ配列決定法として、他の配列決定法(ライゲーションによる配列決定、SBL)、ハイブリダイゼーション法による配列決定(ハイブリダイゼーション、SBHによる配列決定)( Drmanac R.etら、2001; Drmanac R.etら、1989; Drmanac S.etら、1998) および技術的な限界に到達しない、のような大規模なアプリケーションは、これらの技術は、総称している。第一世代の配列決定


第二世代シーケンシング技術は、ヒトゲノムプロジェクト(シュスター、2008)の誕生の順序を伴っています。1990年以降、増加規模シークエンシングで、ハイスループットシークエンシングプラットフォーム、第二世代の配列決定技術は、(フラーEFら、2009 ;.浮上している 。Shendureandチ、2008; Mardis 2008年、等王西を2010)。世代配列が3つの配列決定方法:Iluminaの副合成技術ゲノム分析配列決定プラットフォームに基づいて、当該技術分野で開発され、; ロシュのピロシーケンス 454の配列決定は、また知られており、ここで技術に基づき、ロシュは、GSJuniorシーケンシングプラットフォームをGSFLXを開発しました; ABI社は、技術開発、接続ソリッドシーケンシングプラットフォームを使用しています。

最近、第三世代のシーケンシング技術はPacBioのSMRTとオックスフォードナノポアテクノロジー企業に開発されたナノ細孔単一分子シークエンシング技術代表(Klumpp、FOUTS、およびSozhamannan、など ; Niedringhausら、2011年2012年)。基本原理PacBio SMRT前記DNA鋳型とのポリメラーゼの結合、4色は、4つの塩基(dNTP類)、実質的に異なる色の蛍光の異なる対を蛍光標識。DNAポリメラーゼは、長い読み取り長さを達成するための一つのキーがありますが。この技術の配列決定は高速ですが、シークエンシングのエラー率は、15%に達している間。誤り訂正は、複数の配列決定によって行うことができます。オックスフォードナノ細孔技術のシングルナノ細孔単一分子配列決定技術は、電気信号の配列技術に基づいており、従来のシーケンシング技術とは異なります。この技術の鍵は、ナノポアを介して一本鎖DNA塩基は、ナノポアを通って流れる電流の強度が変化する特殊なナノポアを設計することです。電流の変化からの配列決定の目的のために、異なる塩基を識別します。


 

发布了515 篇原创文章 · 获赞 79 · 访问量 17万+

おすすめ

転載: blog.csdn.net/u010608296/article/details/103537155
おすすめ