MIMIC IV データベースのインストール (2)


1. MIMIC IV データ ファイルの取得

MIMIC データベース データの許可を取得すると、MIMIC-IV 公式 Web サイト (公式リンク: https://physionet.org/content/mimiciv/1.0/) ですべての MIMIC-IV データ テーブル圧縮パッケージを取得できます。データファイルを取得するには、指定されたオンライン試験を受ける必要があり、データは試験に合格した後にのみ使用できます. 具体的な申請プロセスはBaiduで見つけることができます. データに問題がある場合や許可がない場合は、それを入手するには、記事の最後にある著者。
1. ダウンロードして解凍します。
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2. 解凍後は、データの圧縮ファイルです。
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2. MIMIC IV インストール データ コードを取得します。

MIMIC-IV データベースをインストールするためのスクリプト コードは、公式の github のリンク (https://github.com/MIT-LCP/mimic-code) で提供されています。
1. ファイルをダウンロードします。
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2. ファイルを解凍します。
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3. 7zip ツールをインストールする

MIMIC-IV のデータ テーブルは非常に大きく、Windows でインポートするために直接 csv テーブルに展開することはできません.load_7z.sql を使用してインポートするには、7zip をダウンロードしてインストールする必要があります。
1. 最初に 7zip インストール パッケージをダウンロードし、ダブルクリックしてインストールし、インストール パスを選択して、[インストール] をクリックします。
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2. 環境変数を構成します。
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3. MIMIC IV インストールデータ

1. PostgreSQL シェルに入り、起動します。
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2. データベース mimiciv を作成します。

DROP DATABASE IF EXISTS mimiciv;
CREATE DATABASE mimiciv OWNER postgres;

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3. データベースにテーブルを作成します (ファイル パスは独自のデータのパスに置き換えられることに注意してください)。

\c mimiciv
\set mimic_data_dir 'F:/mimic/mimic-iv-1.0'
\i F:/mimic/mimic-code-main/mimic-iv/buildmimic/postgres/create.sql

4. データをロードします。

--------------------
\i F:/mimic/mimic-code-main/mimic-iv/buildmimic/postgres/load_7z.sql

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データの読み込みには時間がかかりますので、しばらくお待ちください。

mimiciv データ ファイルを取得したい場合 (データの抽出と分析を支援するために有料でスクリプトをプログラムまたは作成することもできます)、または質問がある場合は、私にプライベート メッセージを送信してください。

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転載: blog.csdn.net/weixin_44830949/article/details/126938433