r ソースパッケージをインストールして、ローカル r パッケージをインストールします

要約すると、R パッケージを手動でインストールします - Jianshu (jianshu.com) icon-default.png?t=N7T8https://www.jianshu.com/p/2a7a36414734


#BiocManager::install("simplifyEnrichment")
#BiocManager::install("EnsDb.Hsapiens.v86")


#下载包 之后 手动安装
#install.packages("~/datasets/EnsDb.Hsapiens.v86_2.99.0.tar.gz", repos = NULL, type = "source")



#remotes::install_github("HaojiaWu/plot1cell",dependencies = TRUE)
library(plot1cell)

 

R パッケージを R 言語でインストールすると、必ずインストール エラーが発生します。実際、多くの場合、R 言語のバージョンと R パッケージのバージョンの不一致が原因です。このとき、R パッケージを自分で手動でインストールする必要があります。色々調べてみましたが、Web記事にはやり方が多くて複雑なのでまとめてみましょう。

どの方法を使用する場合でも、まず R パッケージの公式 Web サイトにアクセスして、ダウンロードする R パッケージのバージョンへのリンクを見つける必要があります。R 公式 Web サイトの
リンク:
https://www.r-project.org
最も近いミラー: https://mirrors.tongji.edu.cn/CRAN/Find
Packages -> 名前順にソートされた利用可能なパッケージのテーブル

1 つ目の方法:
R パッケージをローカルにダウンロードし、R にインストールします。
参考リンク:
https://blog.csdn.net/weixin_30832143/article/details/94986731

setwd("F:\\CNV\\Paper\\Case-control\\mHMM")#设置本地路径
install.packages("mHMM_1.0.zip",repos=NULL)#安装

初心者はこのようなことをあまり好みませんし、インターフェイスを変更するのは非常に面倒です。

2 番目の方法:
強くお勧めします。R パッケージを R に直接ダウンロードしてインストールします。Xiaobai は最初、R でソフトウェアをダウンロードできることを知らなかったので、手動で黙ってダウンロードしたため、愚かに泣き、悔しさを感じました╮(╯_╰)╭。
この友人のおかげで、記事リンク:
https://zhuanlan.zhihu.com/p/129331377

download.file("https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/amap/amap_0.6.tar.gz","amap_0.6.tar.gz")#下载R包
install.packages("amap_0.6.tar.gz",repos=NULL)#安装

3 番目の方法:
ターミナルを使用する場合は、ターミナルでシェル コマンドを使用して R パッケージをダウンロードし、インストールします。
欠点は、R パッケージのライブラリの絶対パスを知る必要があり、始めたばかりの初心者にとっては少し難しいことです, 嘤嘤嘤〒▽〒。
実際、R パッケージのライブラリへの絶対パスは、インストール ソフトウェアによって返されるレポート結果に含まれています。

install.packages("stringi")

アップロード.4e448015.gif

アップロード中...再アップロードがキャンセルされました

設置レポート

絶対パスがわかったら、ターミナルでシェル コマンドを使用して R パッケージをダウンロードし、コンパイルします。

wget -c https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/stringi/stringi_1.0-1.tar.gz#下载R包
R CMD INSTALL -l  /path/to/your/library  /path/to/your/downloaded/package #编译

4 番目の方法:
パーソナル コンピュータを使用していて R インターフェイスを持っている場合は、インターフェイスを通じて実際に操作し、視覚的に R パッケージを手動でインストールできます。これは比較的愚かで、初心者よりも初心者の業界外の友人に適しています。ここで示しているのは Mac OS システムのものですが、Windows も同様であるはずです。
R -> パッケージとデータ -> パッケージインストーラーを開きます

アップロード.4e448015.gif

アップロード中...再アップロードがキャンセルされました

パッケージインストーラーを探す

不足している R パッケージを入力し、「リストを取得」をクリックします。

アップロード.4e448015.gif

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R パッケージのバージョンを検索する

インストールする必要がある R パッケージを選択し、「選択したものをインストール」をクリックしてインストールします。

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アップロード中...再アップロードがキャンセルされました

インストール



著者:イン・シャオアオ
リンク:https://www.jianshu.com/p/2a7a36414734
出典:Jianshu
著作権は著者に属します。商業転載の場合は作者に許可を、非商業転載の場合は出典を明記してください。

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転載: blog.csdn.net/qq_52813185/article/details/130871280