感染性 RNA、病原性 RNA、カプシド ウイルスとしても知られるウイロイドは、知られている最小の感染因子です。ウイロイドの研究は、生命の起源と進化、生命プロセスの実現、および生命科学におけるその他の主要な理論的問題の解明に貢献する可能性があります.ハイスループットシーケンスの開発により、ますます多くの学者が研究に注目し始めています.ウイロイドの。ViroidDB は、現在知られている中で最も完全なデータベースであり、ウイロイド RNA の分析と分類のための一貫した、利用可能な最新のオープン ソースを提供します。データベースにはhttps://viroids.orgからアクセスできます。
ViroidDB には、現在知られているウイロイドおよびウイロイド環状 RNA 配列が含まれており、ウイロイド、レトロウイルス様エレメント、小型環状サテライト RNA、リボウイルス、逆転写酵素などを含む約 10,000 のユニークな配列をカバーしています。
ViroidDB データベースを使用して、各配列の二次構造、ヌクレアーゼ コンテンツ、およびクラスター メンバーシップを予測し、配列タイプ、分類群、または生データ検索によってデータを閲覧できます。
ViroidDB データベースでは、あいまい検索、高一致検索、シード検索により、基本配列情報、サンプル コレクション情報、塩基配列、およびリソース リンクを FASTA 形式で取得できます。塩基配列を切り替えることで、逆相補配列や二次構造、DNAとRNAの塩基変換を取得でき、塩基配列をFASTA形式で直接コピー・ダウンロードすることもできます。
チップ
Lingen-Yingfei チームは、ライフ サイエンス研究、分子育種、人間の健康の分野における最先端の分子生物学技術とハイ パフォーマンス コンピューティングのアプリケーションの開拓に取り組んでおり、世界をリードするデータ管理と分析ソリューションをユーザーに提供することを目指しています。生命科学の分野で。同社は多くの独立した特許技術とソフトウェア著作権を保有しており、顧客がさまざまな分析ソフトウェア、バイオインフォマティクス分析クラウドプラットフォーム、および数十の動植物種データベースを含む多機能統合データベースおよび管理アプリケーションプラットフォームの開発を成功させ、科学研究を提供するのに役立ちます。安全で便利なデータ管理とアプリケーション ソリューションを提供します。顧客グループには、大学、科学研究機関、第三次病院、疾病管理センター、製薬会社、遺伝子検査会社などが含まれます。
参考文献
ViroidDB: a database of viroids and viroid-like circular RNAs. Nucleic Acids Research, 2021.