Tengo una base de datos MySQL con sólo 1 mesa: Los campos son: blocknr (no el único), btcaddress (no el único), txid (no el único), vin, vinvoutnr, Netvalue.
existen índices en tanto btcaddress y txid.
Los datos en que se ve así: 
Tengo que eliminar todos los pares de registros "eliminables". Se da un ejemplo en rojo. Las condiciones son:
TxID debe ser el mismo (no puede haber más de 2 registros con mismo TxID)
vinvoutnr debe ser el mismo
vin debe ser diferente (sólo puede tener 2 valores 0 y 1, por lo que 1 debe ser 0 otro debe ser 1)
En una tabla de registros 36M, 33M acerca de los registros serán eliminados.
He utilizado este:
delete t1
from registration t1
inner join registration t2
where t1.txid=t2.txid and t1.vinvoutnr=t2.vinvoutnr and t1.vin<>t2.vin;
Funciona, pero tarda 5 horas.
Tal vez esto funcionaría también (no determinado todavía):
delete t1
from registration as t1, registration as t2
where t1.txid=t2.txid and t1.vinvoutnr=t2.vinvoutnr and t1.vin<>t2.vin;
¿O me olvido de una consulta de eliminación y tratar de hacer una nueva tabla con todos los no delatables y luego caer en el original?
Base de datos puede estar fuera de línea para esta consulta de eliminación.
Sobre la base de su pregunta, que va a eliminar la mayor parte de las filas de la tabla. Eso es sólo muy caro. Un mejor enfoque es vaciar la tabla y volver a llenarla:
create table temp_registration as
<query for the rows to keep here>;
truncate table registration;
insert into registration
select *
from temp_registration;
Su lógica es un poco difícil de seguir, pero creo que la lógica en las filas guardar es:
select r.*
from registration r
where not exists (select 1
from registration r2
where r2.txid = r.txid and
r2.vinvoutnr = r.vinvoutnr and
r2.vin <> r.vin
);
Para un mejor rendimiento, desea un índice en registration(txid, vinvoutnr, vin).