Sistema tiene muchas JPanel, cada uno tiene un JPanel JMenuBar diferente, como con el JToolBar JMenuBar en el método JPanel puede ser empleado:
public class BasicGraphEditor extends JPanel
...
protected void installToolAndMenuBar() {
JPanel jp = new JPanel();
jp.setLayout(new BorderLayout());
jp.add(new EditorToolBar(this, JToolBar.HORIZONTAL), BorderLayout.CENTER);
jp.add(new EditorMenuBar(this), BorderLayout.NORTH);
add(jp ,BorderLayout.NORTH);
}