Tumor Genome Atlas (The Cancer Genome Atlas, TCGA) program is funded by the National Cancer Institute (National Cancer Institute, NCI) and the US National Human Genome Research Institute (National Human Genome Research Institute, NHGRI ) project in 2006 jointly launched, At present a total of 33 kinds of cancer types studied.
Parsing the plurality of the molecular mechanisms of cancer TCGA chromatography using large-scale sequencing-based genomic analysis, the genomic, epigenetic group, transcriptome, proteome like. The final completion of a complete change in the patterns associated with all cancer genomes in order to improve the ability of people to the scientific understanding of the molecular basis of cancer and improve our diagnosis, treatment and prevention of cancer. As the largest database of genetic information of cancer, TCGA bears valuable information unimaginable.
By combining multi-omics data analysis TCGA database 33 genomes of cancer, epigenetic group, transcriptome and proteome, etc., AIPuFu platform ( www.aipufu.com ) developed a variety of corresponding free application that helps users Depth multi-omics data mining a variety of cancers, explore the molecular mechanism of tumorigenesis (more exciting please pay attention to micro-channel public number: AIPuFuBio).
Currently, TCGA data AIPuFu platform provides mining applications are:
1, "Query kinds of tumors of different gender, age, race, clinical stage, the survival curve (TCGA data)"
Address: http://www.aipufu.com/goods-507.html
2, "Query controls various cancers and gene methylation differences case (the TCGA data)"
Address: http://www.aipufu.com/goods-504.html
3, "information on the various differences in the control of cancer and gene expression (data the TCGA)"
Address: http://www.aipufu.com/goods-503.html
4、《查询各类肿瘤中两个蛋白的表达水平相关性（CPTAC或TCGA数据）》
地址：http://www.aipufu.com/goods-394.html
5、《查询各类癌症中不同类型基因变异情况总结（TCGA数据）》
地址：http://www.aipufu.com/goods-386.html
6、《绘制各类肿瘤中给定基因/miRNA的表达或甲基化热图（TCGA数据）》
地址：http://www.aipufu.com/goods-376.html
7、《查询各类肿瘤中基因表达或甲基化水平相关性最高的前15个基因（TCGA数据）》
地址：http://www.aipufu.com/goods-374.html
8、《查询各类肿瘤与正常组织中基因的甲基化差异情况（TCGA数据）》
地址：http://www.aipufu.com/goods-363.html
9、《查询各类肿瘤与正常组织中基因的表达差异情况（TCGA数据）》
地址：http://www.aipufu.com/goods-362.html
10、《查询各类肿瘤中两个基因启动子区域的甲基化水平相关性（TCGA数据）》
地址：http://www.aipufu.com/goods-361.html
11、《查询各类肿瘤与对照的基因表达或miRNA表达火山图（TCGA数据）》
地址：http://www.aipufu.com/goods-358.html
12、《查询各类肿瘤中基因的甲基化与表达水平之间的相关性（TCGA数据）》
地址：http://www.aipufu.com/goods-357.html
13、《查询各类肿瘤中基因突变的转换和颠换比率情况（TCGA数据）》
地址：http://www.aipufu.com/goods-356.html
14、《查询各类肿瘤中基因突变与病人生存时间的关系（生存曲线，TCGA数据）》
地址：http://www.aipufu.com/goods-353.html
15、《查询各类肿瘤中基因突变对蛋白功能域的影响（TCGA数据）》
地址：http://www.aipufu.com/goods-351.html
16、《查询各类肿瘤中不同基因突变类型在临床分期中的分布（TCGA数据）》
地址：http://www.aipufu.com/goods-350.html
17、《查询各类肿瘤中突变在基因上的分布及影响（TCGA数据）》
地址：http://www.aipufu.com/goods-349.html
18、《查询各类肿瘤中不同基因突变之间的互斥和共现关系（TCGA数据）》
地址：http://www.aipufu.com/goods-348.html
19、《绘制不同肿瘤中给定基因/miRNA的表达或甲基化热图（TCGA数据）》
地址：http://www.aipufu.com/goods-347.html
20、《查询各类肿瘤中两个基因/miRNA的表达或甲基化相关性（TCGA数据）》
地址：http://www.aipufu.com/goods-345.html
21、《查询各类肿瘤中病人生存时间与基因表达的关系（生存曲线，TCGA数据）》
地址：http://www.aipufu.com/goods-343.html
使用示例：
《查询各类肿瘤不同性别、年龄、种族、临床分期的生存曲线（TCGA数据）》
一、首先可通过两种不同方式找到如下产品：
1、首页（www.aipufu.com）-->所有产品分类-->动物-->人-->TCGA-各类肿瘤数据-->查询各类肿瘤不同性别、年龄、种族、临床分期的生存曲线（TCGA数据）；
2、首页（www.aipufu.com）-->搜索框-->输入相关的关键词“TCGA”-->查询各类肿瘤不同性别、年龄、种族、临床分期的生存曲线（TCGA数据）。
产品地址：http://www.aipufu.com/goods-507.html
二、功能和使用方法
产品功能：《查询各类肿瘤不同性别、年龄、种族、临床分期的生存曲线（TCGA数据）》产品利用TCGA数据集中肿瘤的各种临床信息，绘制特定肿瘤中选定属性（如年龄、性别、种族、分期等）的生存曲线。
使用方法：
1、设置参数：
(i) 在“TCGA肿瘤”中选择您感兴趣的一种肿瘤，有33种肿瘤可供选择，示例中选择了BRCA(Breast invasive carcinoma,乳腺浸润性癌)；
(ii)在“标题”处输入您想在图中显示的标题，示例中为BRCA；
(iii) 在“属性”中选择您感兴趣的层面，有age（年龄），gender（性别），race（人种）和stage（临床分期）四个层面可供选择，示例中为stage；
(iv)在“时间单位”处选择一种您想要您想在图中使用的病人生存时间单位，目前仅支持month（月），示例中选择了month；
(v)在“时间范围(month)”中选择您想在图中显示的病人生存时间范围，有60，120，240和不限四种选择，示例中选择了120；
(vi)若您勾选了“发送到邮箱”，结果将会同时发送到您的邮箱。
(vii)单击“立即运行”，结果图片将在下方显示。
具体如下图所示：
2、上面的参数设置运行的结果如下图所示，结果显示了乳腺癌中四个临床分期的患者的生存时间存在显著差异（P-value=2.28e-19）。您可在右上角“下载图片”处下载该结果的PDF文件，从而可进一步转换为jpg、tiff、png等其他格式。
