基于图的图像分割

基于图的图像分割 Effective graph-based image segmentation

一、前言
二、算法理论

2.1 构建图
2.2 分割图
2.3 算法的实现
2.4 几个分割概念
2.5 算法步骤

三、代码实现

numpy实现

一、前言

最近一段时间在复现基于区域的对比度方法(region-based contrast 简称RC)的显著性检测。【原文请点击】其中，遇到了问题。主要是用到了基于图的图像分割。
显著性检测RC算法：其前期工作就是利用Graph-Based Image Segmentation的分割算法。主要涉及了图网络的一些知识。【关于图网络请点击】。

Graph-Based Image Segmentation是2004年由Felzenszwalb发表在IJCV上的一篇文章，主要介绍了一种基于图表示（graph-based）的图像分割方法。图像分割（Image Segmentation）的主要目的也就是将图像（image）分割成若干个特定的、具有独特性质的区域（region），然后从中提取出感兴趣的目标（object）。而图像区域之间的边界定义是图像分割算法的关键，论文给出了一种在图表示（graph-based）下图像区域之间边界的定义的判断标准（predicate），其分割算法就是利用这个判断标准（predicate）使用贪心选择（greedy decision）来产生分割（segmentation）。
该算法在时间效率上，基本上与图像（Image）的图（Graph）表示的边（edge）数量成线性关系，而图像的图表示的边与像素点成正比，也就说图像分割的时间效率与图像的像素点个数成线性关系。这个算法有一个非常重要的特性，它能保持低变化（low-variability）区域（region）的细节，同时能够忽略高变化（high-variability）区域（region）的细节。这个性质很特别也很重要，对图像有一个很好的分割效果（能够找出视觉上一致的区域，简单讲就是高变化区域有一个很好聚合（grouping），能够把它们分在同一个区域），这也是为什么那么多人引用该论文的原因吧。
【论文请点击】

无论在分割领域还是显著性检测上，都是能够捕捉视觉上重要的区域（perceptually important regions）。举个栗子：在下图1左侧有个红三角，下图2左侧有个更大的红三角，我们可以认为图2的红三角更显眼（更加的靠左侧），
在这里插入图片描述

二、算法理论

该论文主要有两个关键点：

图像（image）的图（graph）表示；
最小生成树（Minimun Spanning Tree）。

2.1 构建图

图像（image）的图表示是指将图像（image）表达成图论中的图（graph）。具体说来就是，把图像中的每一个像素点看成一个顶点 $v_i \in V$ （node或vertex），像素点之间的关系对（可以自己定义其具体关系，一般来说是指相邻关系）构成图的一条边 $e_i \in E$ ，这样就构建好了一个图 $G = (V,E)$ 。
相邻的两个像素点像素颜色值的差异构成边 $(v_i, v_j)$ 的权值 $w(v_i, v_j)$ 。其中权值越小，表示像素点之间的相似度就越高，反之，相似度就越低。图每条边的权值是基于像素点之间的关系，可以是像素点之间的灰度值差，也可以是像素点(RGB)之间的距离：
灰度值素点之间距离： $∣\mathrm{grey} [x_1,y_1]−\mathrm{grey}[x_2,y_2]∣$
像素点(RGB)之间的距离：
$\begin{matrix} \mathrm{imgG} = & (\mathrm{img}[x_1,y_1,0]−\mathrm{img}[x_2,y_2,0])^2 \\ \mathrm{imgB} = & (\mathrm{img}[x_1,y_1,1]−\mathrm{img}[x_2,y_2,1])^2\\ \mathrm{imgR} = & (\mathrm{img}[x_1,y_1,2]−\mathrm{img}[x_2,y_2,2])^2 \end{matrix}.$

$dist = \sqrt(\mathrm{imgG}+\mathrm{imgB}+\mathrm{imgR})$

2.2 分割图

将图像表达成图之后，接下来就是要如何分割这个图。将每个节点（像素点）看成单一的区域，然后进行合并。使用最小生成树方法合并像素点，然后构成一个个区域。大致意思就是讲图（Graph）简化，相似的区域在一个分支（Branch）上面（有一条最边连接），大大减少了图的边数。
图（Graph）分割是将 $G = (V,E)$ 分割成一系列不相交的部分 (component)C，每个C都构成一个子图G。这些子图的之间相互独立 (disjoint)，主要是指它们之间没有公共的点。

2.3 算法的实现

分割区域（Component）的内部差（internal difference）。可以先假定图G已经简化成了最小生成树 MST，一个分割区域C 包含若干个顶点，顶点之间通过最小生成树的边连接。这个内部差就是指分割区域C中包含的最大边的权值。
分割区域（Component）之间的差别（Difference），是指两个分割区域之间顶点相互连接的最小边的权值。

如果两个分割部分之间没有边连接，定义 $Dif(C1,C2) = ∞$ 。分割区域的差别可以有很多种定义的方式，可以选择中位置，或者其他的分位点（quantile，中位置是0.5分位点），但是选取其他的方式将会使得这个问题成为一个NP-hard问题。
分割区域（Component）边界的一种判断标准（predicate）。判断两个分割区域之间是否有明显的边界，主要是判断两个分割部分之间的差别Dif相对于和中较小的那个值MInt的大小，这里引入了一个阈值函数τ 来控制两者之间的差值。下面给出这个判断标准的定义：

其中，是指最小的分割内部差，其定义如下：

阈值函数 $\tau$ 主要是为了更好的控制分割区域边界的定义。比较直观的理解，小分割区域的边界定义要强于大分割区域，否则可以将小分割区域继续合并形成大区域。在这里给出的阈值函数与区域的大小有关。

|C|是指分割部分顶点的个数（或者像素点个数），k是一个参数，可以根据不同的需求（主要根据图像的尺寸）进行调节。

2.4 几个分割概念

如果一个分割S，存在图（Graph）的分割区域之间，没有明显的边界，那么就说这个分割S“太精细”（too fine）。也就是说它们之间没有明显的分界线，硬要把它们分割开来的话，有点过头，也就是说分得太细。
如果一个分割S，存在一个合适的调整（refinement）S’使得S不是”太精细“，那么就说这个分割S”太粗糙“（too coarse）。简单来讲就是，分割程度的还不够（粒度还比较大），可以继续分割，这样刚开始的那个分割就是”太粗糙“（too coarse）了。

对于一个图graph来说，都存在一个分割S，既不是”太精细“（too fine）也不是”太粗糙“（too coarse）。

2.5 算法步骤

对于图G的所有边，按照权值进行排序（升序）
S[0]是一个原始分割，相当于每个顶点当做是一个分割区域
q = 1,2,…,m 重复3的操作（m为边的条数，也就是每次处理一条边）
根据上次 $S[q-1]$ 的构建。选择一条边o[q](vi,vj)，如果vi和vj在分割的互不相交的区域中，比较这条边的权值与这两个分割区域之间的最小分割内部差MInt，如果o[q](vi,vj) < MInt，那么合并这两个区域，其他区域不变；如果否，什么都不做。
最后得到的就是所求的分割 S = S[m]

三、代码实现

C++实现代码请查看：http://cs.brown.edu/people/pfelzens/segment/

class Node:
    def __init__(self, parent, rank=0, size=1):
        self.parent = parent
        self.rank = rank
        self.size = size

    def __repr__(self):
        return '(parent=%s, rank=%s, size=%s)' % (self.parent, self.rank, self.size)

class Forest:
    def __init__(self, num_nodes):
        self.nodes = [Node(i) for i in range(num_nodes)]
        self.num_sets = num_nodes

    def size_of(self, i):
        return self.nodes[i].size

    def find(self, n):
        temp = n
        while temp != self.nodes[temp].parent:
            temp = self.nodes[temp].parent

        self.nodes[n].parent = temp
        return temp

    def merge(self, a, b):
        if self.nodes[a].rank > self.nodes[b].rank:
            self.nodes[b].parent = a
            self.nodes[a].size = self.nodes[a].size + self.nodes[b].size
        else:
            self.nodes[a].parent = b
            self.nodes[b].size = self.nodes[b].size + self.nodes[a].size

            if self.nodes[a].rank == self.nodes[b].rank:
                self.nodes[b].rank = self.nodes[b].rank + 1

        self.num_sets = self.num_sets - 1

    def print_nodes(self):
        for node in self.nodes:
            print(node)

def create_edge(img, width, x, y, x1, y1, diff):
    vertex_id = lambda x, y: y * width + x
    w = diff(img, x, y, x1, y1)
    return (vertex_id(x, y), vertex_id(x1, y1), w)

def build_graph(img, width, height, diff, neighborhood_8=False):
    graph_edges = []
    for y in range(height):
        for x in range(width):
            if x > 0:
                graph_edges.append(create_edge(img, width, x, y, x-1, y, diff))
            if y > 0:
                graph_edges.append(create_edge(img, width, x, y, x, y-1, diff))
            if neighborhood_8:
                if x > 0 and y > 0:
                    graph_edges.append(create_edge(img, width, x, y, x-1, y-1, diff))
                if x > 0 and y < height-1:
                    graph_edges.append(create_edge(img, width, x, y, x-1, y+1, diff))
    return graph_edges

def remove_small_components(forest, graph, min_size):
    for edge in graph:
        a = forest.find(edge[0])
        b = forest.find(edge[1])

        if a != b and (forest.size_of(a) < min_size or forest.size_of(b) < min_size):
            forest.merge(a, b)
    return  forest

# segment_graph(graph_edges, size[0]*size[1], K, min_comp_size, threshold)
def segment_graph(graph_edges, num_nodes, const, min_size, threshold_func):
    # Step 1: initialization
    # [(parent,rank,size) for i in range(num_nodes)]
    forest = Forest(num_nodes)

    weight = lambda edge: edge[2]
    sorted_graph = sorted(graph_edges, key=weight)
    threshold = [ threshold_func(1, const) for _ in range(num_nodes) ]

    # Step 2: merging
    for edge in sorted_graph:
        parent_a = forest.find(edge[0])
        parent_b = forest.find(edge[1])
        a_condition = weight(edge) <= threshold[parent_a]
        b_condition = weight(edge) <= threshold[parent_b]

        if parent_a != parent_b and a_condition and b_condition:
            forest.merge(parent_a, parent_b)
            a = forest.find(parent_a)
            threshold[a] = weight(edge) + threshold_func(forest.nodes[a].size, const)
    return remove_small_components(forest, sorted_graph, min_size)

numpy实现

主要使用numpy数组，去除了类的使用

def segment_graph(height_width, num, edges, c=20.0, min_size=200):
    u_array = np.zeros((height_width, 3), dtype=np.int32)
    u_array[:, 1] = np.array(range(height_width), dtype=np.int32)
    u_array[:, 2] = np.ones(height_width, dtype=np.int32)
    thresholds_copy = np.full(height_width,c,dtype=np.float32)
    loop_range = range(num)

    for i in loop_range:
        edge = edges[i]
        a = edge['a']
        while a!=u_array[a,1]:
            a =edge['a']= u_array[a, 1]
        b = edge['b']
        while b!=u_array[b,1]:
            b =edge['b']= u_array[b, 1]
        if a != b:
            if edge['w'] <= thresholds_copy[a] and edge['w'] <= thresholds_copy[b]:
                if (u_array[a, 0] > u_array[b, 0]):
                    u_array[b, 1] = a
                    u_array[a, 2] += u_array[b, 2]
                else:
                    u_array[a, 1] = b
                    u_array[b, 2] += u_array[a, 2]
                    if u_array[a, 0] == u_array[b, 0]:
                        u_array[b, 0] += 1
                while a != u_array[edge['a'], 1]:
                    a = edge['a'] = u_array[edge['a'], 1]
                thresholds_copy[a] = edge['w'] + c/u_array[a,2]
    for i in loop_range:
        while (edges[i]['a'] != u_array[edges[i]['a'],1]):
            edges[i]['a'] = u_array[edges[i]['a'],1]
        while (edges[i]['b'] != u_array[edges[i]['b'],1]):
            edges[i]['b'] = u_array[edges[i]['b'],1]
        if ((edges[i]['a'] != edges[i]['b']) and ((u_array[edges[i]['a'],2] < min_size) or (u_array[edges[i]['b'],2] < min_size))):
            if (u_array[edges[i]['a'], 0] > u_array[edges[i]['b'], 0]):
                u_array[edges[i]['b'], 1] = edges[i]['a']
                u_array[edges[i]['a'], 2] += u_array[edges[i]['b'], 2]
            else:
                u_array[edges[i]['a'], 1] = edges[i]['b']
                u_array[edges[i]['b'], 2] += u_array[edges[i]['a'], 2]
                if u_array[edges[i]['a'], 0] == u_array[edges[i]['b'], 0]:
                    u_array[edges[i]['b'], 0] += 1
    return u_array


# ===========================SegmentImage==========================================
# 像素间的差异度量
def diff(img3f, x1, y1, x2, y2):
    p1 = img3f[y1, x1]
    p2 = img3f[y2, x2]
    return np.sqrt(np.sum(np.power(p1 - p2, 2)))


def SegmentImage(smImg3f, c=20.0, min_size=200):
    height, width = smImg3f.shape[:2]
    edges = np.zeros((height-1)*(width-1)*4+(height-1)+(width-1),
                     dtype={'names': ['a', 'b','w'],'formats': ['i4', 'i4','f4']})
    num = 0
    width_range = range(width)
    height_range = range(height)
    for y in height_range:
        for x in width_range:
            if x < width - 1:
                edges[num]['a'] = y * width + x
                edges[num]['b'] = y * width + (x + 1)
                edges[num]['w'] = diff(smImg3f, x, y, x + 1, y)
                num += 1
            if y < height - 1:
                edges[num]['a'] = y * width + x
                edges[num]['b'] = (y + 1) * width + x
                edges[num]['w'] = diff(smImg3f, x, y, x, y + 1)
                num += 1
            if (x < (width - 1)) and (y < (height - 1)):
                edges[num]['a'] = y * width + x
                edges[num]['b'] = (y + 1) * width + (x + 1)
                edges[num]['w'] = diff(smImg3f, x, y, x + 1, y + 1)
                num += 1
            if (x < (width - 1)) and y > 0:
                edges[num]['a'] = y * width + x
                edges[num]['b'] = (y - 1) * width + (x + 1)
                edges[num]['w'] = diff(smImg3f, x, y, x + 1, y - 1)
                num += 1
    edges = np.sort(edges, order='w')
    u_array = segment_graph(width * height, num, edges, c=20.0, min_size=200)
    marker = {}
    imgIdx = np.zeros((smImg3f.shape[0], smImg3f.shape[1]), np.int32)
    idxNum = 0
    for y in height_range:
        for x in width_range:
            comp = y * width + x
            while (comp != u_array[comp, 1]):
                comp = u_array[comp, 1]
            if comp not in marker.keys():
                marker[comp] = idxNum
                idxNum += 1
            idx = marker[comp]
            imgIdx[y, x] = idx
    return idxNum, imgIdx

cython实现
主要用来加速该算法运算时间
【关于详情请点击查看】

特别鸣谢：
https://blog.csdn.net/u014796085/article/details/83449972
https://blog.csdn.net/surgewong/article/details/39008861
C++:https://blog.csdn.net/ttransposition/article/details/38024605