区块链技术在快速应用的同时，其安全隐患也不容忽视。中企通宝区块链技术研究负责人认为，区块链在应用过程中的安全问题主要体现在三个方面。
一是区块链系统本身的安全问题，包括智能合约的安全漏洞以及区块链平台的安全漏洞问题。
二是网络资产的基础安全问题，此类问题属于传统安全问题对区块链应用系统的影响，主要体现在APP、Web系统，及APP与Web系统背后业务系统这三个方面。从技术角度看，则包括开源代码安全漏洞、业务逻辑安全漏洞以及其他方面开发漏洞。
三是办公与开发系统的安全问题，即区块链应用系统的开发商，其办公系统或开发环境被暴露在了互联网上，并且因存在安全漏洞而可以被攻击者渗透。
值得注意的是，有专家对区块链技术应用的必要性产生怀疑。有种观点认为，稳健的区块链体系必然需要高成本。虽然区块链应用不断拓展，但目前尚未成为像互联网一样支撑大规模业务运行的基础设施，区块链还处于“拿着钥匙找门”的阶段，是否适合大规模商用还没有定论。