생명 과학 그룹 :
호흡 사슬의 비교를 위해 진핵 유전자 의 외부에 위치 미토콘드리아, 핵의 호흡 기능에 관련 같이 외측 코어를 코딩하는 유전자 이상이다. 두 유전자의 상호 작용이, 다른 종 인코딩 할 수 있는지 여부를 확인하고 싶 ATP6 및 ATP8 계통 공동 orthologous 유전자 건축 상기 열도 나타내 어질 수있는 현상 블록 관찰, 상관 계수를 산출 할 수도 상자 그릴 수 클래스, 상당한 차이가 볼 수있는 사이에 상호 비교. 상기 동작은 상호 작용이 기지 데이터는 표준 값을 수득하기 위해 동일한 작업을 수행하는데 사용될 수 있는지 여부를 결정되는 설정 값이나도를 얻을 수있다. 둘 사이의 상호 작용은 복합체를 수득 비교.
딥 (단백질 상호 작용 데이터베이스)와 PCN 이 기존 데이터베이스 운영자의 상관 계수. CoevDB는 단백질 상호 작용을 찾을 수있는 데이터베이스에 알려진 단백질이다. PID는 데이터베이스에 포함 된 정보의 단백질 - 단백질 상호 작용이다.
그러나 거짓 양성, 위양성 이유는 대개가 1 에 종의 소수는 허용되지 않습니다 2. 직접적인 상호 작용하지만 기능적으로 관련된 단백질을 찾을 수 있습니다. 비교적 높은 위양성율 때문에 사용될 수있다 { 실험 질량 분석 및 유전자 및 단백질} 상호 인증의 조합을 예측하기위한 방법.
이는 단백질 구조, 단백질 - 단백질 상호 작용을 예측의 원리를 이용하여 예측 될 수있다. 이 템플릿을 사용하여 상호 작용 데이터베이스 Y2H 및 기능 도메인 상호 작용을. 결과는 더 복잡한 내장 된 직접 막이다, 그러나 대부분이 효과를 얻을 수 없습니다. 다른 결과는 기능 도메인 또는 도메인과 상호 작용을 모두 발견된다. 사용할 수있는 소프트웨어입니다 봉사 RosettaDock .
작은 단백질 저 전위, 시간의 양은 시료 비 코딩 간주되기 전에 예측 된 RNA의 단백질을 인코딩 후의 데이터 이후 발견 될 수 커지고있다. 보존 영역이있는 힌트 기능의 중요성이있다. 체크 미만 확인할 수 30AA의 도메인 또는 상보 작용의 조합에 기초하여, 도메인의 길이를 중복 게놈 큰 지도록, 시스테인 등의 종의 진화 동안 다른 아미노산 변화의 수의 비율 (증가 안정화 차지 그 안정화 갖는 화합물 1. 킬레이트 금속 이온 2 소수성 3 디설파이드 결합). 작은 회계에서 단백질을 보존 다른 단백질에 비해 보수적 인 단백질, 새로운 기원의 초기 기원과 비교는 새로운 규제 기능의 기원은 가변 길이의 길이를 증가시키기 위해, 그 이유는 일반적인 기능과 함께 고대의 단백질, 그리고 단백질의 특정와 단백질의 새로운 진화 할 수있다 , 그 구조를 길게하는 것을 계속한다.
메타 지노믹스 및 미생물 다양성
미생물 종의 풍부한 다양성 (종의 즉, 수)와 균일 성을 중심으로 (즉, 각 번호)
교양 종에 해당하는 군 유전체학 데이터, 실험실 환경에서 즉 배양 없습니다. 따라서, metagenome는 제약, 환경과 질병 지역에서 사용할 수. 처음에 기반 기술 사용 16sRNA는 상기 저장된 모든 종류를 측정 할 수 게놈 결국 미생물의 분류에 따라 서열 분석 할 수있다. 측정 환경의 모든 유전자에 한 번 측정이 있기 때문에 메타 지노믹스에서 발생하는 어려움은 읽고 대응을 아종 모르겠어요.