2、美佐統計SRR結果

参考:

https://www.sogou.com/link?url=hedJjaC291NYNxVe4xgB4c3bUxXRMqZrT93cntTAgYfyBbRAdP9kIA ..

https://liucheng.name/457/

公式サイトをダウンロードします。

https://webblast.ipk-gatersleben.de/misa/index.php?action=3&help=2 ##ミサをダウンロード

https://webblast.ipk-gatersleben.de/misa/index.php?action=3&help=3 ## p3_in.pl p3_out.plダウンロード

1、ミサの使用:perlのミサ.plの  prefix.10k.fa ## FAシーケンスは世代で区切られた2つのポイントを持っている、と同じディレクトリmisa.plパラメータファイルを持っている必要があります  misa.iniを。結果の生成prefix.10k.fa.misaを、  prefix.10k.fa.statistics 

prefix.10k.fa.misa:表形式で一覧タイプとマイクロサテライト遺伝子座;

prefix.10k.fa.statistics:タイプとマイクロサテライト統計周波数の数。

2、Perlの  p3_in.pl  prefix.10k.fa.misaパラメータprefix.10k.fa.misa primer3_core入力フォーマットを増加させるために適合され、そして出力は、##  prefix.10k.fa.ssr.p3in

。3、primer3_core実行生成され、ホーム/ renpp / BIOSOFT / PRIMER3 / primer3_core <prefix.10k.fa.ssr.p3in> prefix.10k.fa.ssr.p3out ## が出力されprefix.10k.fa.ssr.p3out

。4、p3_out.pl 処理のために設計されたプライマーは、天然の読み出しフォーマットはPerlのp3_out.pl prefix.10k.fa.ssr.p3out prefix.10k.fa.misa ##の結果を生成する生成prefix.10k.fa.ssr .p3out.primer.xls

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転載: www.cnblogs.com/renping/p/10938081.html