Page JS では、jar パッケージに静的リソース メソッドが導入されています
重要なのは、静的リソースを jar の META-INF/resources ディレクトリにパッケージ化し、Maven 設定を行うことです。
<resource>
<directory>${basedir}/src/main/webapp</directory>
<includes>
<include>assets/**</include>
</includes>
<targetPath>META-INF/resources</targetPath>
</resource>
js をページに直接インポートするだけです。
<script src="assets/server.js" type="text/javascript"></script>
同名のファイルを上書きする必要がある場合は、現在のプロジェクトの同じリソース ディレクトリに同じ名前の新しいファイルを作成することで上書きできます。