統計手法の選択
参考文献
統計手法の選択
T 検定と分散分析で満たすべき条件は、1. 正規分布に従うこと、2. 分散の均一性に従うことですが、満たされない場合はノンパラメトリック検定を使用します。
パラメトリックテストとは
発現差解析とは
名前が示すように、差次的発現解析は 2 つのデータセット間に差異があるかどうかを解析することです。たとえば、北部人は南部人よりも著しく背が高いのでしょうか? これには「重要」の定義が関係します。何が重要ですか? 高さ 2 cm は重要ですか、それとも高さ 5 cm は重要ですか? もちろんこれは統計的に言えばそうです。通常は、2 つのデータ グループ間の差の倍数に対して統計検定を実行し、得られた P 値が特定のしきい値に達した場合、それは有意差とみなされます。トランスクリプトームにおける遺伝子発現差の解析では、一般的なスクリーニング基準は、遺伝子発現差が 2 を超え、FDR ≤ 0.05 を有意差とする遺伝子です。もちろん、この基準は、差倍数を 1.5 に減らす、FDR ≤0.01 など、実際のデータに応じて調整することもできます。