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UniProt は、欧州バイオインフォマティクス研究所 (EMBL-EBI)、スイス バイオテクノロジー情報センター (SIB)、およびタンパク質情報リソース (PIR) が共同で管理するタンパク質の配列および機能情報を提供するデータベースです。
UniProt は、UniProt Knowledge Base (UniProtKB)、UniProt Non-Redundant Reference Collection (UniRef)、および UniProt Archive (UniParc) の 3 つの主要な部分で構成されています。
- UniProtKB は、2 つのサブパートで構成される高品質のアノテーション データベースです: UniProtKB/Swiss-Prot (既知のタンパク質配列と機能情報を含む、専門家によって手動でアノテーションが付けられるデータベース); UniProtKB/TrEMBL (コンピュータによって自動的にアノテーションが付けられるタンパク質配列を含むデータベース)ゲノム、トランスクリプトーム、プロテオームのプロジェクトから収集されました。
- UniRef は、検索を高速化するために作成された非冗長タンパク質コレクションで、UniProtKB 内のタンパク質を配列類似性に基づいて 3 つのコレクション (UniRef100、UniRef90、および UniRef50) に分割します。
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