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atha.fasta的前10行 打印出来
head -n 10 atha.fasta
atha.fasta的前10行 放到一个文件里面 重定向
head -n 10 atha.fasta>head10.fasta
查看里面的内容 10行 10个字符(一个单词)698字符
wc head10.fasta
cat head10.fasta
cat head10.fasta|wc -l
cat head10.fasta|wc
后10行 覆盖原来的 (一个>号)
tail -n 10 atha.fasta>head10.fasta
wc head10.fasta
cat head10.fasta
后10行 追加原来的 两倍重复 (两个个>>号) 20行
提取 atha.gff 的 400- ک 500行,打印输出到subset.gff
(一)head -n 500 atha.gff> temp.gff
tail -n 101 temp.gff>subset.gff
rm temp.gff
(二)管道 | 不要中间 (水桶)
head -n 500 atha.gff | tail -n 101 temp.gff>subset.gff
查看፡ atha.fasta 有多少条序列
less -S atha.fasta 内容
grep ">" atha.fasta 所有包含>的行 筛选出来
grep ">" atha.fasta |wc 统计 wc命令
grep -c ">" atha.fasta grep命令
检查大豆中的基因 是否有重复,若果有,把重复的拿出来
ls -l *fasta 所有的fasta文件
ls -l -h *fasta
grep ">" gmax.fasta|less 拿到 交给less,打开 这个命令的输出
grep ">" gmax.fasta|sort |uniq |wc 去重复
grep ">" gmax.fasta|wc 没有去重复