これは学術詐欺ですか？

皆さん、こんにちは。前回のライブブロードキャストの後:エンリッチメント分析の結果は理想的ではありませんでした。何千もの用語から必要な用語をすべて見つけるにはどうすればよいでしょうか?

サイト b で誰かが質問しました。これは濃縮分析の結果を人為的に変更したものとみなされますか?

アップオーナー: Shengxin 博士

エンリッチメント分析のジレンマ

エンリッチメント分析を実行すると、多くの場合、数千の用語を含む結果が得られるため、その後の研究が困難になります。

私の解決策

生放送では、数千の用語の中から欲しい用語をすべて見つける方法を紹介しました。この方法では、まずフィルタリングおよびソート方法を使用して検索範囲を絞り込み、次に手動スクリーニング方法を使用して最終的に必要な用語を決定します。

生放送で言及された濃縮分析結果の人為的改変の問題については、私の答えは「そうではない」です。

なぜあえてこれをするのか

エンリッチメント分析は統計手法であり、その結果はデータ品質、アルゴリズムの選択、パラメーター設定などの多くの要因の影響を受けます。したがって、濃縮分析結果の正確性を完全に保証するものではありません。

この場合、手動スクリーニングを使用して必要な条件を決定するのが合理的なアプローチです。手動スクリーニングにより、研究者の経験と知識に基づいて不合理な結果を排除できます。特定の用語をスクリーニングする場合、当社の予備実験に基づいてスクリーニングすることができます。より詳細な説明については、ビデオを参照してください。

エンリッチメント分析には最新のデータベースを使用する必要がありますか?

濃縮分析に使用されるデータベースは、大量の実験データに基づいて構築されており、新しい研究結果が継続的に発表されるにつれて、データベースは継続的に更新されます。したがって、最新バージョンのデータベースを使用してエンリッチメント分析を行うことで、より正確な結果を得ることができます。
ただし、すべてのエンリッチメント分析で最新バージョンのデータベースを使用する必要があるわけではありません。研究の目的が経路または機能の一般的な特性を理解することだけである場合は、古いバージョンのデータベースを使用すると、より良い結果が得られます。

最後に、次の質問について考えてみましょう。

エンリッチメント分析に使用されるデータベースは常に更新されていますが、なぜ最新バージョンを使用したいのですか? しかし、使用しているデータベースが最新バージョンかどうか知っていますか?
エンリッチメント分析の結果から、詳細な調査のために上位 10 の経路、さらには上位 1 の経路を選択したのはなぜですか? トップ２が正しいんじゃないの？トップ20はどうなるのでしょうか？それはどうやって判断するんですか...
研究の信頼性は実験や生体認証分析に基づいていますか?

追記

実験は生物学研究の基礎であり、生物学的仮説を直接検証できます。バイオインフォマティクス分析は、大量のデータから潜在的なパターンを発見し、実験研究の方向性を提供します。この記事のテクニックは難しいものではなく、誰もが独自のアイデアを発展させるのに役立つ考え方です。

さらにコミュニケーションを図るには、コミュニケーショングループに参加し、学校の名前を書き留めてください。

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