PyCTD | Python连接CTD数据库查询、下载和处理数据

1 PyCTD介绍

  CTD数据库(Comparative Toxicogenomics Database)整合大量化学物质、基因、功能表型和疾病之间相互作用数据,为疾病相关环境暴露因素及药物潜在作用机制研究提供极大便利,自于2004年发布以来一直是广受好评。该数据库目前更新至2021年版本,总计超过4664万上述相互作用数据,包括超过230万种化学物质、46689个基因、4340个表型和7212种疾病信息。
  PyCTD包是由弗劳恩霍夫算法和科学计算研究所生物信息学系(SCAI)开发,为从CTD查询数据提供了自动化的处理方式,不仅能够自动化的查询而且还能够连接MariaDB 或者是MySQL 实现数据的永久存储。

2 PyCTD的安装

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