本人下载编译安装了opencv2.4.9，oppencv2.4.10，opencv2.4.11，opencv3.0.0，opencv3.1.0，opencv3.2.0版本，总结anaconda下opencv安装经验如下。
1.编译好的opencv和自己编译安装opencv的区别
Ubuntu安装了anaconda以后，
$condainstall opencv
直接安装网上编译好的opencv，但是Ubuntu，python以及opencv不同版本之间使用都有差异，容易出问题；但是如果没出问题的话，这确实是最简单的安装方式.
$pipinstall opencv-python
或者$apt-get installpython-opencv
或者$conda install –c https://conda.binstar.org/menpoopencv
具有同样问题，所以有的人选择自己编译安装opencv.
比如直接
$conda installopencv
之后，调用cv2.destroyAllWindows()时有时会出现：
Thefunction is not implemented. Rebuild the library with Windows, GTK+ 2.x orCarbon support. If you are on Ubuntu or Debian, install libgtk2.0‑dev and pkg‑config, then re‑runcmake or configure script
这就是网上编译好的opencv包在编译的过程中设置的选项可能和你当前需求不一样，解决方法就是自己编译安装opencv
2. Ubuntu下anaconda卸载opencv
安装前首先把之前的opencv卸载掉，conda install装的就用condauninstall卸，其他的安装方式也按照对应方式卸载就可以了.
然后
$cd /usr/local/lib
$sudo rm–r opencv相关的包
$cd/usr/local/include
$sudo rm–r opencv相关的包
看看/usr/local/下有没有其他opencv，有的话一并删除
删除一系列包可以用rm –r opencv*，以opencv开头的包就都会被删掉
3.安装opencv依赖包
在安装opencv之前需要先处理好依赖包，有的教程会告诉你下面两条：
$sudoapt-get update
$sudoapt-get upgrade
这两条不是必要的，有的包升级完了又是bug，比如numpy包升到1.12就会出现floatX64的问题，所以不用这两条也没问题
下面这些依赖包还是要装的：
$sudoapt-get install build-essential libgtk2.0-dev libjpeg-dev libtiff4-dev libjasper-devlibopenexr-dev cmake python-dev python-numpy python-tk libtbb-dev libeigen3-devyasm libfaac-dev libopencore-amrnb-dev libopencore-amrwb-dev libtheora-devlibvorbis-dev libxvidcore-dev libx264-dev libqt4-dev libqt4-opengl-devsphinx-common texlive-latex-extra libv4l-dev libdc1394-22-dev libavcodec-devlibavformat-dev libswscale-dev default-jdk ant libvtk5-qt4-dev
4.编译安装opencv
本人下载编译安装了opencv2.4.9，2.4.10，2.4.11，3.0.0，3.1.0，3.2.0，不同版本出的问题不一样，主要问题是cmake的差异，以及依赖包版本的差异
官网下载opencv源码
解压opencv源码
$cd 解压好的opencv文件夹
$mkdirbuild
$cdbuild
//万一编译失败，删掉build和/usr/local/下相应的opencv文件就行，不用把整个解压的opencv都删掉
//好看，才一行一行写的，没必要换行的
$cmake-D
CMAKE_BUILD_TYPE=Relese-D
CMAKE_INSTALL_PREFIX=/usr/local-D
WITH_TBB=ON-D BUILD_NEW_PYTHON_SUPPORT=ON -D
WITH_V4L=ON-D INSTALL_C_EXAMPLES=ON -D
INSTALL_PYTHON_EXAMPLES=ON-D
BUILD_EXAMPLES=ON-D
WITH_OPENGL=ON-D
WITH_VTK=ON..
//opencv3.x版本这么写是没有问题的，2.x版本需要指定CUDA，而3.x版本指定CUDA的话编译会出问题.
//有的cmake里还有WITH_QT=ON，QT4和QT5版本问题在这里也经常出现，这条别写了
//看看你的ffmpeg是否是YES，有的ffmpeg包在2.x版本是NO的状态，make不下去的，先去装好ffmpeg
$make
//有的写成make j2，make j4，make j8等，就是为了加速
//make过程中，如果是3.x的版本，downloadthe file ippicv_linux_xxxxxxx.tgz会非常非常慢，还会出现校验码对不上的问题，自己下载ippicv_linux_xxxxxxx.tgz文件，拷到对应文件夹下，它正在下载那个删掉就可以了.
$sudomake install
将自己生成的动态链接库添加到系统能找到的路径:
$sudogedit /etc/ld.so.conf.d/opencv.conf
在打开的写字板中填写/usr/local/lib
保存，并$sudo ldconfig
这个写法和下面的写法是等效的
$sudo -s
$echo"usr/local/lib" > /etc/ld.so.conf.d/opencv.conf
$sudoldconfig
设置路径：
$sudogedit /etc/bash.bashrc
文件末尾添加并保存：
PKG_CONFIG_PATH=$PKG_CONFIG_PATH:/usr/local/lib/pkgconfig
exportPKG_CONFIG_PATH
5.测试
$python
$import cv2
如果出现no module named cv2，那就把cv2.so拷到anaconda/lib/python2.7/site-packages下
$filename= "1.jpg"
$img =cv2.imread(filename)
$cv2.imshow("img",img)
$cv2.destroyAllWindows()
没问题就装好了
6.如果实在还没有解决
如果还有问题，那就不一定是opencv的问题了，重装anaconda试试吧.
参考：
http://www.samontab.com/web/2014/06/installing-opencv-2-4-9-in-ubuntu-14-04-lts/