バイオインフォマティクス
細胞説:7つの主なポイント
すべての既知の生物は、1つまたは複数のセルで構成されています。
すべての生きている細胞は、分裂によって、既存の細胞から生じます。
セルは、すべての生命体における構造と機能の基本単位です。
生物の活性は独立セルの総活性に依存します。
エネルギーの流れ(代謝および生化学)は、細胞内で発生します。
細胞は、染色体に特異的に見出され、RNAが細胞核と細胞質に見出されるDNAを含みます。
すべての細胞は、基本的に同様の種の生物における化学組成が同じです。
遺伝子型転写 - 遺伝子機能表現型
バルクRNA-seqのhttps://www.youtube.com/watch?v=UgslMZ74ums
セラー異質の細胞の不均一の理由形態&転写&ゲノム&プロテオーム、セラー異質性への細胞の不均一リード腫瘍。以下のために腫瘍使っPD1 / PDL1を今使用して、個々のニーズに基づいて、無効SINGLEに、細胞分析、人口ベースのコホートを。
単一細胞分析の課題は、少量を持っているので、分離技術は、繰り返しを必要とすることが必要です。
中国の教授唐豊富な報酬
単一細胞の単離分離技術とその特性
限界希釈後、細胞ウェルを希釈する目的を達成するために、ウェル中の細胞の最初の列に加えました。
マイクロマニピュレーションピペットでは、目的の細胞を選択します
LCMの蛍光が行う選択を。
FACSは、フローサイトメトリーでソート高スループット、今主流の技術。例えば、10倍ゲノミクス|液滴
MACS ビーズ細胞を加えるスクリーニング。
10Xゲノミクスビーズからなるプローブによって特徴付けられる油滴内にラップビーズ、:のR1 +バーコード(名)+ UMI (異なるRNA配列を同定)+ ポリ。
液滴は、液滴が細胞をカプセル化を特徴とします。
単一細胞cDNAの増幅即ちcDNAを三つの方法で増幅しました。
1.PCR 増幅2. in vitro転写増幅3.phi29 ポリメラーゼ増幅PMA
マイルストーンのタイムライン
分析のワークフロー:
帰属:他の細胞の使用RNA 欠損値を補うために
次元削減方法:
PCA | tSNE | DM :
解析ソフトウェア:
示差発現解析
細胞亜集団の識別
細胞系譜と状態軌道セル軌道/行数とpseudotime再構成/推論ソフトウェア:
アプリケーション胚の開発など
ヒト細胞アトラスヒト細胞マッピング・プロジェクトの:
分類:細胞タイプの細胞型
組織学:細胞周辺に位置し、位置
開発:分化した細胞型への移行
生理homeosrasis 同源性:サイクル、過渡応答および塑性状態
病:細胞と細胞の生態系
メカニズムの分子:細胞内の細胞内および細胞間の回路
空間的に分解トランスクリプトームのスペース転写:空間的スペース
URL: https://www.spatialomics.org/SpatialDB/
STは、組織チップ上にメッキされ、チップは、対応する穴の発現を確認するために、各ポイントは、フェッチ表す遺伝子を同一の測定に対応することができる、異なる位置に遺伝子の異なる位置における発現レベル。
スライド配列は、単一細胞レベルであることができる対応するチップの穴の発現を確認するために、チップ上の組織にタイル張りされます。
LCM-F
SeqFISH&MERFISH セルの各点
一対細胞シング肝細胞について
|ジオ配列トモ配列の発現プロファイル線形EG 胚をセクションに切断され、各セグメントの発現量:
空間DB コレクション
転写空間群:インタラクション空間の各セルの情報と環境と
LAMPウェブサーバ---基本知識ネットワークの知識のフレームワーク:
MOOC :W3Schoolsのウェブサイト:https://www.w3cschool.cn/
ハイパーテキストマークアップ言語(HTML)
カスケーディングスタイルシート(CSS)
ブートストラップ
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