バイオインフォマティクスの分析は、データリソースやデータベースと切り離すことはできません.バイオインフォマティクスデータベース分類の概要(初版)は、一般的に使用される機能データベースを体系的に分類します.
次に、私たちが公開することを約束した 7 つのデータベース、4 つの NAR、1 つの BIB、1 つの Nature プロトコル、1 つの Science Bulletin、1 つの iMETA を読者のために共有します。
処方箋、医薬品材料、ターゲット、疾患、経路などに関する情報を含む、伝統的な漢方薬の処方箋のデータベース。
ウェブサイトはアンティークで、美しくデザインされ、インタラクティブな探索、ネットワークの雰囲気、
良い姿は良い踏み台であり、
2018年にNARマガジンに掲載されました。
(http://www.tcmip.cn/ETCM/)
表の表示は退屈すぎます。重要な情報のインタラクティブな円グラフの表示、表示、クリックしてフィルタリングします~~
現在、データベースはより多くの機能とより多くの表示を備えた第 2 版にアップグレードされています (ネットワーク図は、下のものよりも美しく、生物学的に意味があり、よりインタラクティブですが、当面は公開できませんo(╥﹏╥ )o)、第三弾も進行中。
もう1つは、細菌のゲノムから活性のあるファージを探す「プロファージハンター」です。
このページは最小限ですが、適切に設計されたカスタム ゲノム ブラウザとのやり取りです。
2019年にNARマガジンに掲載されました。(https://pro-hunter.bgi.com/)
テーブルブラウザとゲノムブラウザの双方向制御
もう1つは、美しいページと強力な機能を備えた海洋天然物データベースです。2020 NAR データベース特集号に掲載されました。(http://www.cmnpd.org)
マルチモーダル複合検索
美しいページと強力な機能を備えた大規模動物腸内フローラデータベース!2022 NAR データベース特集号に掲載されました。(http://www.ehbio.com/CRAMdb/)
植物根細菌のハイスループット分離、培養、同定のためのオンライン分析プラットフォームは、2021 年に Nature Protocol に掲載されました。
さらに行われるのは、BIBジャーナルに掲載されたトランスクリプトーム関連データの表示など、分子データの表示です。(www.devomics.cn)
まず第一に、プロのデザイナーがカスタマイズできるホームページを表示します.それは伝統的でも現代的でもかまいません;
ホームページのグローバル検索ボックスはGoogleに似ており、遺伝子名、経路名、機能性キーワードを入力して検索できます。
小さなカルーセルは、ウェブサイトで実行できる分析と結果の表示を示し、差分遺伝子濃縮の完全なセットはインタラクティブです。
データベースに収録されているサンプルや属性情報を4つの円グラフがリンクして表示され、高級感のある雰囲気がその意味合いを表しています。
では検索すると、どのような情報が表示されるのでしょうか。
遺伝子、エイリアス、公開データベース リンク、機能的注釈、発現分布、PPI ネットワーク、共発現ネットワークなど、なんでも構いません!
1つの遺伝子は小さすぎて遺伝子群の発現プロファイルと修飾プロファイルを描くことができませんが、同時にメチル化修飾と遺伝子発現の関係を示しています。
写真は表示されません、絶対に私が思うことです!
検索が単純すぎます (実際、機能は非常に強力です)。さらに条件を指定して検索できますか?
マルチオミクスはどのように提示されますか? ゲノムブラウザを組み込むことはできますか?
ゲノムブラウザは、マルチオミクスの強力な表示ツールです。詳細は次を参照してください。
IP
ChIP データは、 Input
サンプルの存在量 (このバイモーダル マップは切り離して組み合わせることができます) と情報を同時に表示しますpeak
。下の図を参照してください。
相同種表示も可能ですよ~
より多くのオンライン機能、サンプル クラスタリング、スクリーニング、差分遺伝子 (サンプル固有の遺伝子)、機能強化 (小さなクラウド プラットフォームが出てきました)
よりインタラクティブなプロット、染色体マップ、円グラフ、箱ひげ図、インタラクティブな表
データベースに含まれるサンプル情報のよりインタラクティブな表示
これはホームページのスタイルでもあり、カスタマイズ可能です。
より多くの地図表示
時間軸が1つに変わる
1 つの訪問統計ページ (これは高価値のカスタマイズ可能なオンライン描画ツールです。ユーザー訪問の第 3 版で、合計訪問数は 200,000 です。訪問を促進するためのフレンドリーなリンクを作成します)
上記のいくつかはリストされており、さらに多くのデータベースがまだ構築中であり、出版後にゆっくりとリリースされる予定です.さらに多くのプレゼンテーションと要求があなたの提案を待っています.
また、施工が必要な場合は、QRコードをスキャンしてお問い合わせください。
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