R言語APRIORI連想ルール、K-MEANS平均値クラスタリング解析漢方薬特許調合薬ルールネットワーク可視化|コードデータ付

全文リンク: tecdat.cn/?p=30605

最近、クライアントから、漢方薬の特許化合物治療に関する研究報告書を作成するよう依頼されました。これには、いくつかの図と統計出力が含まれます。

アソシエーション ルールやクラスタリング手法などのデータ マイニング手法を適用して、伝統的な漢方薬の特許化合物処方の適合性ルールを分析します。

方法:伝統的な漢方薬の特許配合処方を検索し,外用漢方薬および漢方薬と西洋薬の併用の配合処方を除外した。私たちは最近、投薬の規則性に関する調査レポートを書くように依頼されました。これには、グラフや統計の出力が含まれます。選択された伝統的な漢方薬の特許化合物は、用語の標準化によって処理され、情報が抽出され、表が作成され、データ分析ソフトウェア R を使用してデータの関連付けルールが分析され、ネットワーク分析ソフトウェアを使用してクラスター分析が実行されました。

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バイナリ行列データに変換

colnames(data) <- paste0("X",1:ncol(data))

database <- NULL
for(i in 1:nrow(data)) {
  tmp <- integer(length(total_types))
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アプリオリに構築する

plot(all_rules, method = "graph")
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R 言語は、アソシエーション ルールとクラスタリング モデルを使用して処方データをマイニングし、薬物適合性のルールを調査します。

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伝統的な漢方薬の特許化合物処方ペアの関連付けルールの分析

薬のペアは処方の互換性の基本的な形であり、伝統的な漢方薬の間の互換性関係を反映しています。薬対の漢方薬は、処方箋を組み合わせると同時に処方箋に現れるという特徴があるため、相関規則の分析では、規則を高い信頼度で分析することで、薬対を得ることができます。方法協会。 写真

信頼とサポートに基づいて強力な関連付けルールをフィルタリングする

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K-means 平均ネットワーク クラスター分析

うつ病の伝統的な漢方薬の特許化合物の薬物間で複雑な適合性関係のネットワークが形成されます. 相関規則分析を使用して、薬物のペアと強力な相関規則を見つけることができます. 出現により、適合性法則の分析が困難になり、アプリケーションのネットワーク クラスタリング方法は、互換性の法則を効果的に見つけることができます。

#聚类类别号
kmod$cluster
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各カテゴリの強い関連ルールを表示する

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クラスタ 1

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クラスタ 2

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互換性関係ネットワークのクラスター分析結果は、うつ病の治療に一般的に使用される伝統的な漢方薬の「コミュニティ」を示しました。これは、複合処方において比較的密接で固定された互換性を持つ伝統的な漢方薬のいくつかの組み合わせを反映しており、臨床応用は改善することができます治療効果。


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転載: juejin.im/post/7215153930472423485