前段时间用了一下pajek这个可视化工具，不知道是自己不怎么会用还是怎么的，感觉pajek不太容易上手，用起来也复杂，不过pajek集成的功能确实很多，如果深入使用的话估计使用pajek会比较好，但是如果只是一般的应用，那么我还是推荐今天用的这个gephi，Gephi是一个构建在NetBeans平台上用于各种网络和复杂系统，动态和分层图的交互可视化与探测开源工具。可用作：探索性数据分析，链接分析，社交网络分析，生物网络分析等。
进行可视化处理的操作流程还是比较简单的，同时还有中文版本，有一个简单的教程，多种数据输入格式，还能跟pajek的.net数据格式通用，界面也更加的友好一些，设置可视化的图形也更加形象方便。同时还有社区发现，PageRank和Hits算法的计算的功能，很吊的！
需要进行数据可视化的可以对这个工具进行一番捣鼓，还是挺好玩的，
项目主页在这里：http://gephi.org/
同时有一个中文的视频在这里：http://www.udemy.com/gephi
还找到了一个比较详细的pdf教程是：gephi教程.pdf，这个可以到新浪分享平台上搜到。